我有以下功能:defget_denom(n_comp,qs,x,cp,cs):'''len(n_comp)=1#numberofproteinslen(cp)=n_comp#proteinconcentrationlen(qp)=n_comp#proteincapacitylen(x)=3*n_comp+1#fitparameterslen(cs)=1'''k=x[0:n_comp]sigma=x[n_comp:2*n_comp]z=x[2*n_comp:3*n_comp]a=(sigma+z)*(k*(qs/cs)**(z-1))*cpdenom=np.sum(a)+csreturn
我已阅读Cythondebugging,putabreakpoint,和https://groups.google.com/forum/#!topic/apam-python-users/6rsRwcCAms4想知道调试从python代码调用的cython代码时最好的工作流程是什么?理想情况下,我想在从我的IDE(pycharm)启动的python调试session期间进入.pyx文件,但似乎这是不可能的。pyx文件被cython化后,是否可以编译调试信息以便调试器介入?如果无法实现,有哪些替代方案(除了不使用cython!)?由于这个问题专门问如何单步进入cython代码,虽然它类似
我已经创建了一个Cython代码来在密集矩阵和稀疏向量之间进行矩阵运算,如下所示(因为我正在学习Cython,我不确定这是一个好的代码,但这是我能想到的最好的代码到目前为止):importnumpyasnpcimportnumpyasnpctypedefnp.float64_tdtype_tctypedefnp.int32_tdtypei_tcimportcython@cython.boundscheck(False)@cython.wraparound(False)@cython.nonecheck(False)defcdenseXsparse(np.ndarray[dtype_t,
我有一个Python脚本,我将脚本重命名为.pyx文件。我想将这段代码编译成一个标准的dll文件。我在thisdocument中看到Cython将创建一个dll文件,但我只得到一个pyd。我有mingw并尝试使用命令pythonsetup.pybuild--compiler=mingw32来编译脚本我的代码(只是一个helloworld):definit():return"helloworld"有什么想法吗?谢谢 最佳答案 所以首先要做的是重命名文件到helloworld.pyx。现在我们需要制作setup.py,就像一个pytho
考虑以下四个函数(python、numba、cython和smart),它们计算相同的响应当给出相同的整数输入时defpython(n):total=0forminrange(1,n+1):total+=mreturntotalfromnumbaimportjitnumba=jit(python)cpdefintcython(intn):cdefinttotal=0cdefintmforminrange(1,n+1):total+=mreturntotaldefsmart(n):returnn*(n+1)//2为他们的执行安排时间我有点惊讶地发现numba的运行时独立于n(而cytho
我在学习Cython并遇到了这段代码:importnumpyasnpcimportnumpyasnpdefmean(np.ndarray[np.double_t]input):cdefnp.double_tcur#Py_ssize_tisnumpy'sindextypecdefPy_ssize_ticdefPy_ssize_tN=len(input)forifrom0显然,这会返回a的平均值,即2.5。我的问题是:for循环是Python循环、Cython还是C? 最佳答案 编译并查看:Cython生成的C代码带有很好的注释。/*"
我想在我的ubuntu12.04上安装cython,我在终端中输入了sudoeasy_installcython作为响应,我收到以下错误:SearchingforcythonReadinghttp://pypi.python.org/simple/cython/Readinghttp://www.cython.orgReadinghttp://cython.orgBestmatch:Cython0.16Downloadinghttp://www.cython.org/release/Cython-0.16.zipProcessingCython-0.16.zipRunningCytho
使用cython进行编译是否可以与python3.4Django应用程序一起使用,或者它是否可以在不付出大量努力的情况下工作?这个答案-https://stackoverflow.com/a/7347168/805141-一个关于保护python代码的问题促使我问这个问题。类似的问题之前已经问过但关于提高性能:UsingCythonwithDjango.Doesitmakesense? 最佳答案 是的,我们做到了。但它指向持续的疼痛。我们制作了一款安装在客户场所的商业产品,用于管理他们的Genesys电力联络中心。该应用程序的核心是
TLDR:在cython中,为什么(或何时?)遍历numpy数组比遍历python列表更快?一般来说:我以前使用过Cython,并且能够比naivepythonimpl获得巨大的速度提升',然而,弄清楚到底需要做什么似乎并不简单。考虑以下3个sum()函数的实现。它们驻留在一个名为“cy”的cython文件中(显然,有np.sum(),但这不是我的观点..)朴素的python:defsum_naive(A):s=0forainA:s+=areturns带有期望python列表的函数的Cython:defsum_list(A):cdefunsignedlongs=0forainA:s+=
我正在编写一个python类,我想使用cython早期键入来加速执行。当我尝试用cython编译以下内容时,出现错误“C变量声明中的语法错误”:importnumpyasnpcimportnumpyasnpclassMyClass:def__init__(self,np.ndarray[double,ndim=1]Redges):self.Redges=Redgescdefdoubleself.var1错误涉及涉及self.var1的最后一行的语法。我不能直接输入类属性吗?我是否总是必须将其分为两步,例如,cdefdoublevar1self.var1=var1完整的错误回溯是,tes