我正在尝试在Cython中进行计算,这些计算严重依赖于一些numpy/scipy数学函数,例如numpy.log。我注意到如果我在Cython的循环中重复调用numpy/scipy函数,会产生巨大的开销成本,例如:importnumpyasnpcimportnumpyasnpnp.import_array()cimportcythondefmyloop(intnum_elts):cdefdoublevalue=0forninxrange(num_elts):#callnumpyfunctionvalue=np.log(2)这非常昂贵,大概是因为np.log通过Python而不是直接调用
我正在尝试在Cython中进行计算,这些计算严重依赖于一些numpy/scipy数学函数,例如numpy.log。我注意到如果我在Cython的循环中重复调用numpy/scipy函数,会产生巨大的开销成本,例如:importnumpyasnpcimportnumpyasnpnp.import_array()cimportcythondefmyloop(intnum_elts):cdefdoublevalue=0forninxrange(num_elts):#callnumpyfunctionvalue=np.log(2)这非常昂贵,大概是因为np.log通过Python而不是直接调用
Non-zeroexitcode(1):_pydevd_bundle/pydevd_cython.c:13:20:fatalerror:Python.h:Nosuchfileordirectorycompilationterminated.error:command'x86_64-linux-gnu-gcc'failedwithexitstatus1请帮助我解决在PyCharm中尝试安装Cython的错误。 最佳答案 JetBrains给出了答案:https://www.jetbrains.com/help/pycharm/2017
Non-zeroexitcode(1):_pydevd_bundle/pydevd_cython.c:13:20:fatalerror:Python.h:Nosuchfileordirectorycompilationterminated.error:command'x86_64-linux-gnu-gcc'failedwithexitstatus1请帮助我解决在PyCharm中尝试安装Cython的错误。 最佳答案 JetBrains给出了答案:https://www.jetbrains.com/help/pycharm/2017
因此,我正在尝试帮助另一个用户,在此过程中,我无法创建一个Cython程序来在Numpy之外做一些简单的事情,从而迫使我使用GIL。因此,这使得使用OpenMP(Multicore)不可能。然后,我遇到了一个有趣的帖子,而您可以直接从Scipy将Fortran库导入到Cython代码(Blas,Lapack)中,这些代码是用Numpy安装的,在我的情况下,IntelMKL等效函数。我要做的就是一个简单的向量乘法,将2个向量1000x1尺寸乘以另一个尺寸,该尺寸被转移,从而产生了1000x1000矩阵。但是我找不到可以解决问题的相关fortran例程(相当于numpy倍增)。所有例程似乎都会
报错内容如下图所示:Preparingmetadata(setup.py)...errorerror:subprocess-exited-with-error×pythonsetup.pyegg_infodidnotrunsuccessfully.│exitcode:1╰─>[6linesofoutput]Traceback(mostrecentcalllast):File"",line2,inFile"",line34,inFile"/tmp/pip-install-a509pn1e/cython-bbox_4f8cde4aec364123b4ba34e507b2a155/setup.py"
我们有一个基于python的模块,我们希望通过创建linux系统可理解的编译副本(即.so文件)分发给我们的客户我们已经评估了cython,它很容易做到这一点,但我们看到它创建了与.pyx/.py文件一样多的.so文件,但我们想为完整的包创建一个super.so文件。我们希望在某种意义上巧妙地做到这一点,如果我们将来向其他模块添加依赖项,uber编译文件应该具有所有依赖项。有什么建议,我们如何才能巧妙地做到这一点? 最佳答案 cx_freeze可以创建可重新分发的python模块包。例如:cxfreezemy_script_usin
我们有一个基于python的模块,我们希望通过创建linux系统可理解的编译副本(即.so文件)分发给我们的客户我们已经评估了cython,它很容易做到这一点,但我们看到它创建了与.pyx/.py文件一样多的.so文件,但我们想为完整的包创建一个super.so文件。我们希望在某种意义上巧妙地做到这一点,如果我们将来向其他模块添加依赖项,uber编译文件应该具有所有依赖项。有什么建议,我们如何才能巧妙地做到这一点? 最佳答案 cx_freeze可以创建可重新分发的python模块包。例如:cxfreezemy_script_usin
我创建了一个简单的helloworld程序,并尝试使用gcc执行生成的C程序,但无论我做什么,我都会得到一大堆undefinedreference。SO上有很多类似的问题,但他们都说要安装python-dev(或它的某些变体)或添加用于链接和加载库的标志,但我已经尝试了这两个选项。你好.pydefmain():print"Hello,World!"if__name__=="__main__":main()我跑:cython--embedhello.py然后我尝试以以下形式运行gcc的一些变体:gcc-I/usr/include/python2.7/-L/usr/lib/python2.
我创建了一个简单的helloworld程序,并尝试使用gcc执行生成的C程序,但无论我做什么,我都会得到一大堆undefinedreference。SO上有很多类似的问题,但他们都说要安装python-dev(或它的某些变体)或添加用于链接和加载库的标志,但我已经尝试了这两个选项。你好.pydefmain():print"Hello,World!"if__name__=="__main__":main()我跑:cython--embedhello.py然后我尝试以以下形式运行gcc的一些变体:gcc-I/usr/include/python2.7/-L/usr/lib/python2.