一、conda昨天知道网管已经给我们安装了很多软件在服务器上，今天看了一下，发现我们只要export调用就行。从前我自己安装了miniconda，然后就一直报错。。是不是也可以用网管的版本。于是一番尝试，终于成功啦。#addedbyanacondaexportPATH="/data/software/anaconda2/bin:$PATH"输入conda就可以看到简介信息啦。再次感谢大牛网管，默默为自己之前非要自己安装的愚蠢行为哀悼。但是也不能说没有用处，至少知道了安装的过程嘛。二、FastQC软件（更新：安装运行day18日日记为准，遇到各种java错误，命令错误，比如~后面没有写/；比如=
一、conda昨天知道网管已经给我们安装了很多软件在服务器上，今天看了一下，发现我们只要export调用就行。从前我自己安装了miniconda，然后就一直报错。。是不是也可以用网管的版本。于是一番尝试，终于成功啦。#addedbyanacondaexportPATH="/data/software/anaconda2/bin:$PATH"输入conda就可以看到简介信息啦。再次感谢大牛网管，默默为自己之前非要自己安装的愚蠢行为哀悼。但是也不能说没有用处，至少知道了安装的过程嘛。二、FastQC软件（更新：安装运行day18日日记为准，遇到各种java错误，命令错误，比如~后面没有写/；比如=
一、质控前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件，现在需要对fastq文件进行质控，这里用的软件为fastqc。首先建好文件夹用来存放数据mkdir01raw02clean03alin04countfastqc1.pngR1=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_1.fastq.gzR2=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_2.fastq.gzfastqc$R1$R2这步会产生一个html文件，这就是fastqc的结果，我们可以双击在网页中打开进行查看。（详见下面介绍的fas
一、质控前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件，现在需要对fastq文件进行质控，这里用的软件为fastqc。首先建好文件夹用来存放数据mkdir01raw02clean03alin04countfastqc1.pngR1=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_1.fastq.gzR2=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_2.fastq.gzfastqc$R1$R2这步会产生一个html文件，这就是fastqc的结果，我们可以双击在网页中打开进行查看。（详见下面介绍的fas
