写在前面：本文内容出自生信技能树的生信入门系列课程笔记，感谢小洁老师、Jimmy老师的分享。GEO数据挖掘分析思路：1.找数据，找到GSE编号2.下载数据（表达矩阵、临床信息、分组信息）3.数据探索（分组之间是否有差异，PCA、整个数据的热图）4.limma差异分析及可视化（P值、logFC，火山图、差异基因的热图）5.富集分析KEGG、GO注意：该标准流程只适用于表达芯片分析，甲基化、SNP等芯片的流程详见生信技能树专题。GEO表达芯片分析的要点:解决probe_id与genesymbol、样本编号GSM与分组之间的对应关系。GO富集的3个方面：1.分子功能（MolecularFunctio
GEO数据库下载单细胞测序原始数据如果想要分析数据库中的数据，可以从文献中获得数据的GSE号，举个例子：image.png然后到NCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(nih.gov)搜索GSE144024，就会得到如下信息：image.png其中，GSM号为样本编号，后面有详细信息。点击SRARUNSelector，就可以看到每个样本的SRR号。image.png选择想要下载的SRR，点击selected-accessionlist，就可得到一个编号的文本文件。但是呢想要下载，还得需要借助其他软件sratools。image.pngsrat
GEO数据库下载单细胞测序原始数据如果想要分析数据库中的数据，可以从文献中获得数据的GSE号，举个例子：image.png然后到NCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(nih.gov)搜索GSE144024，就会得到如下信息：image.png其中，GSM号为样本编号，后面有详细信息。点击SRARUNSelector，就可以看到每个样本的SRR号。image.png选择想要下载的SRR，点击selected-accessionlist，就可得到一个编号的文本文件。但是呢想要下载，还得需要借助其他软件sratools。image.pngsrat
ascp/aspera对于生信中较大数据的下载上传是非常快速的，谁用谁知道！像NCBI(GEO/sra)就是在用，总之两个字：真香！。今天来教大家如何安装ascp以及如何利用ascp从GEO下载数据。在这里呢，我已经给大家下载好了，在下面网盘中下载就行了，设置的永久有效哦。链接：https://pan.baidu.com/s/18yRK_2mVnKM_IeXrcWpbyg提取码：eyvb1.安装ascpbash/你的ascp放的路径/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh安装完成后，应该会出现下面的提示：InstallingAsperaConnectDe
ascp/aspera对于生信中较大数据的下载上传是非常快速的，谁用谁知道！像NCBI(GEO/sra)就是在用，总之两个字：真香！。今天来教大家如何安装ascp以及如何利用ascp从GEO下载数据。在这里呢，我已经给大家下载好了，在下面网盘中下载就行了，设置的永久有效哦。链接：https://pan.baidu.com/s/18yRK_2mVnKM_IeXrcWpbyg提取码：eyvb1.安装ascpbash/你的ascp放的路径/aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.sh安装完成后，应该会出现下面的提示：InstallingAsperaConnectDe
BoundsautomaticallychangesonUIScrollViewwithcontentinsets我使用UIScrollView作为我的分页滚动视图，pagesScrollView。在其中，我放置了专门用于缩放的单个UIScrollView。在其中的每一个中，我都有一个视图，它是应该可以缩放的页面项目。所有这些都在带有半透明导航栏的UINavigationController中。我的pagesScrollView有contentInset.top=64和bounds.origin.y=-64(这对我来说似乎很奇怪，但这是系统自动为我设置的)，这很好用。我的屏幕看起来很棒！但是，
BoundsautomaticallychangesonUIScrollViewwithcontentinsets我使用UIScrollView作为我的分页滚动视图，pagesScrollView。在其中，我放置了专门用于缩放的单个UIScrollView。在其中的每一个中，我都有一个视图，它是应该可以缩放的页面项目。所有这些都在带有半透明导航栏的UINavigationController中。我的pagesScrollView有contentInset.top=64和bounds.origin.y=-64(这对我来说似乎很奇怪，但这是系统自动为我设置的)，这很好用。我的屏幕看起来很棒！但是，
Chromevs.box-sizing:border-boxinadisplay:table我正在使用display:table做一个小的2窗格布局。对于间距(也来自背景图像)，我使用padding。由于我需要孩子从可用空间中获得精确的width:50%(考虑到父div的填充)，所以我使用box-sizing:border-box.这在Opera中运行良好，但在Chrome中，box-sizing:border-box甚至-webkit-box-sizing:border-box会被默默忽略。我做了一个演示来说明这个问题。两个红框应该是方形的，蓝框应该是宽高200px：http://jsfid
Chromevs.box-sizing:border-boxinadisplay:table我正在使用display:table做一个小的2窗格布局。对于间距(也来自背景图像)，我使用padding。由于我需要孩子从可用空间中获得精确的width:50%(考虑到父div的填充)，所以我使用box-sizing:border-box.这在Opera中运行良好，但在Chrome中，box-sizing:border-box甚至-webkit-box-sizing:border-box会被默默忽略。我做了一个演示来说明这个问题。两个红框应该是方形的，蓝框应该是宽高200px：http://jsfid
