由于我linux系统崩了，于是我开始探索再windows环境完成RNA-seq分析，实际情况是windows完全够用（如果内存足够），不然还是选择用服务器分析。网上对于kallisto的使用教程并不详细，也主要集中在linux系统，于是我想分享一下我使用kallisto的经验。这是我的分析流程，大家可以参考一下。1.安装kallistokallisto是一个免费的转录组拼接软件，在linux和windows-CMD里都可以运行，使得你的rowdata被拼接为可以进行下游操作的readcount这样的matrix。以下是下载安装的官网：https://pachterlab.github.io/k

⚠️不想充值付费的小伙伴可以点赞，会随机挑选幸运观众赠送全文。NGS分析手把手教学系列继WGS全基因组分析以后终于更新啦。这次是RNA-seq转录组分析。本文主要是指导操作流程，不会浪费篇幅在解释RNA-seq原理上。本章会使用人类基因组，比较组间的差异基因。其他物种的数据同样适用。所有代码都亲测可用(2022年9月），由于一些老旧版本的工具以及网络协议已经没法使用，所以也会有最新版本工具安装教学内容。除了需要修改路径和文件名，读者基本只需要复制黏贴就可以复现所有操作。这次主要介绍的管道工具是运用在很多生信服务器上的国际标准STAR，以及另外一款很常用并且配置不高的笔记本也能快速运行的kall

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