limma差异表达分析本篇笔记的内容是在R语言中利用limma包进行差异表达分析,主要针对转录组测序得到的基因表达数据进行下游分析,并将分析结果可视化,绘制火山图和热图[TOC]基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步,不管哪种差异分析,其本质都是广义线性模型,limma也是广义线性模型的一种,其对每个gene的表达量拟合一个线性方程。limma包是2015年发表在NucleicAcidsResarch一个做差异分析的工具,目前引用次数高达七千多次,最流行的差异分析软件之一就是limma。环境部署与安装安装limma包if(!require("BiocManager",quietly=T