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maftools包分析突变数据,绘制瀑布图

前面给大家介绍了MAF文件格式☞MAF格式(mutationannotationformat)以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。☞如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somaticmutation)今天我们来讲讲,怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据,并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能,分析和可视化。下图列出了,这个包中相应的函数的名字。我们先用maftools包自带的数据,给大家讲解这个包的使用方法。后面再来实战,重现SCI文章中的瀑布图。#安装maftools包BiocManager::install("maftools"

maftools包分析突变数据,绘制瀑布图

前面给大家介绍了MAF文件格式☞MAF格式(mutationannotationformat)以及如何从TCGA数据库下载MAF格式的突变数据。☞如何从TCGA数据库下载体细胞突变数据(somaticmutation)今天我们来讲讲,怎么用R的maftools包来分析MAF格式的突变数据,并用瀑布图来展示结果。maftools这个包的主要分为两部分功能,分析和可视化。下图列出了,这个包中相应的函数的名字。我们先用maftools包自带的数据,给大家讲解这个包的使用方法。后面再来实战,重现SCI文章中的瀑布图。#安装maftools包BiocManager::install("maftools"