背景介绍mecat2可以说是比较早的一批可以用于三代测序平台的基因组组装软件了,2017年刚上硕士的时候就有接触到过。当然还有WTDBG2也是差不多同时期的软件。软件安装这次没法无脑conda了,得从源码开始编译。就当忆苦思甜吧,见识一下如果没有conda加持,软件安装是一个什么样的过程。不过mecat2的安装已经是比较新手友好型的了。gitclonehttps://github.com/xiaochuanle/MECAT2.gitcdMECAT2make记得把MECAT/Linux-amd64/bin的路径加入环境变量以便全局调用哦。软件运行1.生成输入文件把多个测序文件的存储路径写入fas