之前有过用二代测序的数据组装植物叶绿体基因组昆虫线粒体的经历，用的是单位的超算（Linux系统）。这里的二代测序数据是全基因组的浅层测序数据，因为叶绿体和线粒体是多拷贝的，一般浅层测序数据就可以组装出完整的叶绿体和线粒体基因组。我的单个样本（昆虫）测序数据大小是4G，仅供参考。用到的软件为Getorganelle和Mitofinder，这里介绍Mitofinder。Mitofinder官网：https://github.com/RemiAllio/MitoFinder下面的教程基本来自于对官网教程的翻译，如有需要可以去看官网原文。Mitofinderisapipelinetoassemblem
