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贝叶斯统计学派(先验,似然,后验),以Beta分布和Dirichlet-multinomial模型为例

贝叶斯统计学派的一些理解在计算后验分布前,从先验分布p(θ)p(\boldsymbol{\theta})p(θ)开始。先验分布反映了我们在看到具体数据前对参数的认知。似然函数p(D∣θ)p(\mathcal{D}\mid\boldsymbol{\theta})p(D∣θ)反映的是在θ\boldsymbol\thetaθ下观测事件发生的概率。运用条件分布的贝叶斯公式,我们可以通过以下方式计算后验分布:p(θ∣D)=p(θ)p(D∣θ)p(D)=p(θ)p(D∣θ)∫p(θ′)p(D∣θ′)dθ′p(\boldsymbol{\theta}\mid\mathcal{D})=\frac{p(\bold

python - Tensorflow中的numpy随机选择

Tensorflow中是否有与numpy随机选择等效的函数。在numpy中,我们可以从给定列表中随机获取一个项目及其权重。np.random.choice([1,2,3,5],1,p=[0.1,0,0.3,0.6,0])此代码将从给定列表中选择具有p个权重的项目。 最佳答案 不,但您可以使用tf.multinomial获得相同的结果:elems=tf.convert_to_tensor([1,2,3,5])samples=tf.multinomial(tf.log([[1,0,0.3,0.6]]),1)#notelog-probel

python - Tensorflow中的numpy随机选择

Tensorflow中是否有与numpy随机选择等效的函数。在numpy中,我们可以从给定列表中随机获取一个项目及其权重。np.random.choice([1,2,3,5],1,p=[0.1,0,0.3,0.6,0])此代码将从给定列表中选择具有p个权重的项目。 最佳答案 不,但您可以使用tf.multinomial获得相同的结果:elems=tf.convert_to_tensor([1,2,3,5])samples=tf.multinomial(tf.log([[1,0,0.3,0.6]]),1)#notelog-probel

python : How to use Multinomial Logistic Regression using SKlearn

我有一个测试数据集和训练数据集如下。我提供了包含最少记录的样本数据,但我的数据有超过1000条记录。这里E是我的目标变量,我需要使用算法对其进行预测。它只有四个类别,如1、2、3、4。它只能采用这些值中的任何一个。训练数据集:ABCDE120301122212332345657731243556541125301122231931231411170314823604测试数据集:ABCDE11211211123456789987653411212412由于E只有4个类别,我想到使用多项逻辑回归(1与Rest逻辑)进行预测。我正在尝试使用python来实现它。我知道我们需要在变量中设置这些

python - 向量化 numpy.random.multinomial

我正在尝试向量化以下代码:foriinxrange(s.shape[0]):a[i]=np.argmax(np.random.multinomial(1,s[i,:]))s.shape=400x100[给定]。a.shape=400[预期]。s是一个二维矩阵,其中包含成对的概率。期望多项式从s矩阵的每一行中抽取一个随机样本,并将结果存储在向量a中。 最佳答案 在comments,据说有人试图将这个here向量化然而,这不仅仅是一次尝试。也是这个问题的完整解决方案。问题的目标是获取包含多项式事件的1的位置的索引。也就是说,以下实现[0

利用 Dirichlet-multinomial regression 计算不同条件下亚群丰度变化

image.png方法来源于上面这篇文章,不得不说,这篇文章运用了非常多复杂的方法去阐述关注的科学问题,真不愧是出自Broadinstitute实验室的。我这里暂时只讲下文章中一种比较新颖的比较不同条件下亚群丰度变化的方法。首先我们先了解下Dirichlet-multinomialregression。让我们从数学层面开始:假设从正常组织取了samplei,正常组织本身包含了p种celltype,假设各种celltype出现的概率为Cellprobability,samplei中各种celltype出现的数目为Numberofcelltypesamplei中共有N个cell,全部细胞的总和就是

利用 Dirichlet-multinomial regression 计算不同条件下亚群丰度变化

image.png方法来源于上面这篇文章,不得不说,这篇文章运用了非常多复杂的方法去阐述关注的科学问题,真不愧是出自Broadinstitute实验室的。我这里暂时只讲下文章中一种比较新颖的比较不同条件下亚群丰度变化的方法。首先我们先了解下Dirichlet-multinomialregression。让我们从数学层面开始:假设从正常组织取了samplei,正常组织本身包含了p种celltype,假设各种celltype出现的概率为Cellprobability,samplei中各种celltype出现的数目为Numberofcelltypesamplei中共有N个cell,全部细胞的总和就是