论文https://www.nature.com/articles/s41559-022-01771-6#code-availability论文没有权限下载但是查看数据代码链接的时候发现github主页上提供了论文的下载链接论文中的图做的都非常好看，而且提供数据和代码，我们可以找来学习数据代码链接https://github.com/sebepedroslab/chromatin-evolution-analysis今天的推文我们学习一下论文中提供的画多序列比对的代码。我没有在论文中找到对应的图，只是github的链接里有数据和代码论文中国提供的代码library(stringr)librar
我正在尝试根据此代码https://cloud.google.com/natural-language/reference/rest/v1/documents向Google的CloudNaturalLanguageAPI提出请求在Swift中，但我不能完全正确地理解语法？importFoundationimportSwiftyJSONclassGoogleNaturalLanguageParser{letsession=URLSession.sharedvargoogleAPIKey="XXX"vargoogleURL:URL{returnURL(string:"https://lan
论文Alatitudinalgradientofdeep-seainvasionsformarinefisheshttps://www.nature.com/articles/s41467-023-36501-4s41467-023-36501-4.pdf论文中对应的图实现的代码都有，链接是https://github.com/stfriedman/Depth-transitions-paper里面有个弦图很好看，在论文中对应的是figure3,对应画图代码是上面链接中的figure2image.png论文中的作图数据是没有提供的，这里我就随便构造一个数据，能够把论文中提供的代码运行通就可以示
论文Meta-analysisoftheimpactsofglobalchangefactorsonsoilmicrobialdiversityandfunctionalityhttps://www.nature.com/articles/s41467-020-16881-7#Sec15论文里提供了数据和代码，很好的学习素材这篇论文是公众号的一位读者留言，说这篇论文提供了数据和代码，但是代码比较长，看起来比较吃力。我看了论文中提供的代码，大体上能够看懂，争取抽时间把论文中提供的代码都复现一下。因为论文中的图都对应着提供了作图数据，我们想复现论文中的图。关于用原始数据分析的部分后续有时间在单独介
论文Whole-genomedoublingdrivesoncogeniclossofchromatinsegregationhttps://www.nature.com/articles/s41586-023-05794-2#MOESM10作图数据都有，论文中的图也很好看，抽时间复现今天的推文复现一下论文中的Figure1e三角热图ggplot2能够做这种三角热图，但是怎么让热图的尖朝上，之前还没有尝试过，基本思路就是可以让整个图进行旋转，查了一下怎么让ggplot2整体旋转，很多都是借助grid包的语法来实现，但是grid的作图我还不是很理解，找了好长时间看有没有ggplot2的扩展包可以
论文EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulationhttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04567-7s41586-022-04567-7.pdf数据和代码下载链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP论文中提供的是模拟数据集这个分析的具体原理暂时还看不明白，当前只能试着把代码跑通输入数据集部分截图image.png读取数据集inDFmeta对数据集进行过滤他这里自定义了一个函数，很长很长，这里把他自定义的函数
论文Aglobalreptileassessmenthighlightssharedconservationneedsoftetrapodshttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04664-7#Sec33数据代码链接https://github.com/j-marin/Global-reptile-assessment-今天的推文学习一下推文中的Figure1a的堆积柱形图，没有找到论文中的作图代码，但是找到了原始数据集，有了原始数据集就可以自己写代码来做这个图image.png作图数据集部分截图image.png读取数据集library(rea
论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一下论文中的Figure1d中左下角的小图image.png论文中提供的原始数据集如下image.png需要将其整理成3个单独的数据集image.png首先是做数据整理的代码library(readxl
论文Aglobalreptileassessmenthighlightssharedconservationneedsoftetrapodshttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04664-7#Sec33数据代码链接https://github.com/j-marin/Global-reptile-assessment-今天的推文学习一下推文中的Figure1b的环形堆积柱形图，没有找到论文中的作图代码，但是找到了原始数据集，有了原始数据集就可以自己写代码来做这个图image.png代码可以参考这个链接https://r-graph-galler
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的推文重复一下论文中的figure1bimage.png数据集image.png这里误差线的范围是平均值加减标准差，数据提前算好，整理到csv文件中读取数据library(readr)dat01分组折线
