我有一个包含50000个字符串向量的列表，由6000个唯一字符串的各种组合组成。目标:我想将它们转换为“相对频率”(table(x)/length(x))并将它们存储在稀疏矩阵。低内存消耗比速度更重要。目前内存是瓶颈。(即使源数据大约有50mb并且目标格式的数据有大约10mb-->转换似乎效率低下，...)生成样本数据dims可能的尝试:1)sapply()简化为稀疏矩阵？library(Matrix)sparseRow问题:我的瓶颈似乎是sparseRows因为行没有直接组合到稀疏矩阵。(如果我在完整示例上运行上面的代码，我会得到一个Error:cannotallocatevecto
这个问题在这里已经有了答案:QuitandrestartacleanRsessionfromwithinR?(12个回答)关闭4年前.我正在大规模进行机器学习，但由于R内存占用，我的计算变得如此缓慢。我清除了我的对象，还尝试了gc()和结果:used(Mb)gctrigger(Mb)maxused(Mb)Ncells4460452231.5152888381116.6365990711954.7Vcells29572776349.43245097882712.93507963783376.4我的任务管理器显示Rsession仍然分配了超过3GB的内存并且我的计算机仍然很慢。如何释放R占
这个问题在这里已经有了答案:QuitandrestartacleanRsessionfromwithinR?(12个回答)关闭4年前.我正在大规模进行机器学习，但由于R内存占用，我的计算变得如此缓慢。我清除了我的对象，还尝试了gc()和结果:used(Mb)gctrigger(Mb)maxused(Mb)Ncells4460452231.5152888381116.6365990711954.7Vcells29572776349.43245097882712.93507963783376.4我的任务管理器显示Rsession仍然分配了超过3GB的内存并且我的计算机仍然很慢。如何释放R占
我正在尝试合并两个数据框:一个有33个变量的908450个观察值，另一个有2个变量的908450个观察值。dataframe2我已经从工作内存中清除了所有其他数据帧，并使用以下代码重置了我的内存限制(对于具有24GBRAM的全新桌面):memory.limit(24576)但是，我仍然收到错误Cannotallocatevectorofsize173.Mb.关于如何解决这个问题的任何想法？ 最佳答案 要跟进我的评论，请使用data.table。我整理了一个与您的数据相匹配的快速示例来说明:library(data.table)dt1
我正在尝试合并两个数据框:一个有33个变量的908450个观察值，另一个有2个变量的908450个观察值。dataframe2我已经从工作内存中清除了所有其他数据帧，并使用以下代码重置了我的内存限制(对于具有24GBRAM的全新桌面):memory.limit(24576)但是，我仍然收到错误Cannotallocatevectorofsize173.Mb.关于如何解决这个问题的任何想法？ 最佳答案 要跟进我的评论，请使用data.table。我整理了一个与您的数据相匹配的快速示例来说明:library(data.table)dt1
我收到了名义上的错误:mcfork():Unabletofork:Cannotallocatememory在尝试使用mcapply运行一个函数后，但top说我在51%这是在EC2实例上，但我确实有最新的R。有谁知道还有什么可能导致这个错误？谢谢，-N 最佳答案 问题可能正是错误消息所暗示的:没有足够的内存来fork和创建并行进程。R本质上需要为每个单独的进程创建内存中所有内容的副本(据我所知，它不使用共享内存)。如果您已经在单个进程中使用了51%的RAM，那么您没有足够的内存来创建第二个进程，因为这总共需要102%的RAM。试试:使
我收到了名义上的错误:mcfork():Unabletofork:Cannotallocatememory在尝试使用mcapply运行一个函数后，但top说我在51%这是在EC2实例上，但我确实有最新的R。有谁知道还有什么可能导致这个错误？谢谢，-N 最佳答案 问题可能正是错误消息所暗示的:没有足够的内存来fork和创建并行进程。R本质上需要为每个单独的进程创建内存中所有内容的副本(据我所知，它不使用共享内存)。如果您已经在单个进程中使用了51%的RAM，那么您没有足够的内存来创建第二个进程，因为这总共需要102%的RAM。试试:使
虽然我在某个地方(不记得在哪里)读到过这些因素实际上并不比data.table中的字符向量更有效。这是真的？我在争论是否继续使用因子将各种向量存储在data.table中。object.size的近似测试似乎表明并非如此。chars 最佳答案 您可能还记得data.tableFAQ2.17，其中包含:stringsAsFactorsisbydefaultTRUEindata.framebutFALSEindata.table,forefficiency.SinceaglobalstringcachewasaddedtoR,chara
虽然我在某个地方(不记得在哪里)读到过这些因素实际上并不比data.table中的字符向量更有效。这是真的？我在争论是否继续使用因子将各种向量存储在data.table中。object.size的近似测试似乎表明并非如此。chars 最佳答案 您可能还记得data.tableFAQ2.17，其中包含:stringsAsFactorsisbydefaultTRUEindata.framebutFALSEindata.table,forefficiency.SinceaglobalstringcachewasaddedtoR,chara
运行RJDBC0.2-4的dbGetQuery时出现以下错误:Errorin.jcall(rp,"I","fetch",stride):java.lang.OutOfMemoryError:Javaheapspace以下是我的代码:Sys.setenv(JAVA_HOME='C:/ProgramFiles(x86)/Java/jdk1.7.0_25')options(java.parameters='-Xmx1g')library(rJava)library(rjson)library(RJDBC)#OutputJavaversion.jinit()print(.jcall("java
