如果RDKit安装起来不那么复杂，它可能是一个不错的软件包。在SO上，有几个问题在安装RDKit时出现问题。但是，在不同的操作系统或不同的环境中。我的配置是:Win10，Python3.7.4，pip已安装，PATH已设置，PYTHONPATH已设置。通过python-mpipinstall安装其他模块工作正常.我知道site建议使用Anaconda进行最快的安装。但是，我没有也不想要Anaconda。关于webpage它说:“从以下位置获取适当的Windows二进制版本:https://github.com/rdkit/rdkit/releases”。但是，没有最新版本的二进制文件。

github;地址文章目录Rdkit|分子3D构象生成与优化构象生成算法概述基于距离（distance-based）代码示例距离几何算法生成3D结构距离几何+ETKDG生成3D构象距离几何+ETKDG生成多构象将Conformer类转为Mol类手动对齐距离几何+ETKDG+MMFF生成3D构象距离几何+ETKDG+MMFF生成多构象多线程生成多构象Rdkit|分子3D构象生成与优化RDKit是一款非常强大的分子信息学工具包，其中包含了分子3D构象生成与优化的功能。通过RDKit，您可以将一个分子的2D结构转化为3D结构，并进行能量最小化优化，得到最稳定的构象。构象生成算法概述基于距离（dist

运行rdkit时报如下错误：pythonargumenttypesinrdkit.chem.rdmolfiles.moltosmiles(nonetype)didnotmatchc++signature出现问题时首先分析可能的报错原因rdkit包出现错误，这时候需要卸除原来的rdkit包，并安装新的包待处理的mol文件格式有错误，如果报这个错误就需要查看文件的错误注意：切记不要一报错就认为是软件包的问题我的报错原因就是mols文件格式有误我先用smilestomol包将一个非标准化的smiles文件转化为mol，然后用moltosmiles将mol转化为标准化的smiles。由于我的非标准化s

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分子结构处理MolecularSanitization默认情况下，RDKit读入分子的时候会进行分子结构检查处理（MolecularSanitization）。结构处理的过程中会自动计算一些有用信息，如杂化、环信息等，保证分子的结构在化学上是合理的：价键合理。Sanitization的检查过程，包含11步。clearComputedProps:清除已有的分子、原子、键的计算性质，如Thisstepisalwaysperformed.cleanUp:对非标准价键进行标准化处理，如：5根键的N转换成两性离子的形式。Example:N(=O)=O自动变成[N+](=O)O-]。Example:C-N

分子结构处理MolecularSanitization默认情况下，RDKit读入分子的时候会进行分子结构检查处理（MolecularSanitization）。结构处理的过程中会自动计算一些有用信息，如杂化、环信息等，保证分子的结构在化学上是合理的：价键合理。Sanitization的检查过程，包含11步。clearComputedProps:清除已有的分子、原子、键的计算性质，如Thisstepisalwaysperformed.cleanUp:对非标准价键进行标准化处理，如：5根键的N转换成两性离子的形式。Example:N(=O)=O自动变成[N+](=O)O-]。Example:C-N