我目前正在处理DNA序列数据，但遇到了一些性能障碍。我有两个查找字典/散列(作为RDD)，以DNA“单词”(短序列)作为键，索引位置列表作为值。一个用于较短的查询序列，另一个用于数据库序列。即使是非常非常大的序列，创建表的速度也非常快。下一步，我需要将它们配对并找到“命中”(每个常用词的索引位置对)。我首先加入查找词典，速度相当快。但是，我现在需要这些对，所以我必须进行两次平面映射，一次是从查询中扩展索引列表，第二次是从数据库中扩展索引列表。这并不理想，但我看不到另一种方法。至少它表现不错。此时的输出为:(query_index,(word_length,diagonal_offset
假设我有两个表:people_all和people_usa，它们具有相同的结构，因此具有相同的主键。我怎样才能得到不在美国的人的表格？在SQL中，我会做类似的事情:selecta.*frompeople_allaleftouterjoinpeople_usauona.id=u.idwhereu.idisnullPython的等价物是什么？我想不出将这个where语句翻译成pandas语法的方法。我能想到的唯一方法是在people_usa中添加一个任意字段(例如people_usa['dummy']=1)，进行左连接，然后只取“dummy”所在的记录'是nan，然后删除虚拟字段-这看起来
我有以下时间序列:start=pd.to_datetime('2016-1-1')end=pd.to_datetime('2016-1-15')rng=pd.date_range(start,end,freq='2h')df=pd.DataFrame({'timestamp':rng,'values':np.random.randint(0,100,len(rng))})df=df.set_index(['timestamp'])我想删除这两个时间戳之间的行:start_remove=pd.to_datetime('2016-1-4')end_remove=pd.to_datetime
默认情况下，cx_Oracle将每一行作为元组返回。>>>importcx_Oracle>>>conn=cx_Oracle.connect('scott/tiger')>>>curs=conn.cursor()>>>curs.execute("select*fromfoo");>>>curs.fetchone()(33,'blue')如何将每一行作为字典返回？ 最佳答案 您可以覆盖游标的rowfactory方法。每次执行查询时都需要这样做。这是标准查询的结果，一个元组。curs.execute('select*fromfoo')cu
运行以下代码时出现错误。#!/usr/bin/pythonimportsubprocessimportosdefcheck_output(*popenargs,**kwargs):process=subprocess.Popen(stdout=subprocess.PIPE,*popenargs,**kwargs)output,unused_err=process.communicate()retcode=process.poll()ifretcode:cmd=kwargs.get("args")ifcmdisNone:cmd=popenargs[0]error=subprocess.
所以我想从pdf文件中提取文本，我需要它的位置、宽度、高度、字体。我已经尝试了很多，但最有用和最完整的解决方案看起来是PDFMiner，在这种情况下，更准确地说是pdf2txt.py.我已经按照文档和示例进行操作，并尝试使用以下命令从我的pdf中提取文本了解更多:pdf2txt.py-Ynormal-txml-obuttons.xmlbuttons.pdf输出buttons.xml如下所示:(cid:51)(cid:76)(cid:72)(cid:89)(cid:85)(cid:3)(cid:52)(cid:86)(cid:89)(cid:76)第一个字符应该是L和51(cid:51)
我正在尝试在我的Mac(OS10.7.2)上运行以下代码(来自PyAudio文档的示例):importpyaudioimportsyschunk=1024FORMAT=pyaudio.paInt16CHANNELS=1RATE=44100RECORD_SECONDS=5p=pyaudio.PyAudio()stream=p.open(format=FORMAT,channels=CHANNELS,rate=RATE,input=True,output=True,frames_per_buffer=chunk)print"*recording"foriinrange(0,44100/ch
我在使用SWIG(版本3.0.6)围绕C++库生成Python包装器时遇到了一些问题。我的问题与应用OUTPUT类型映射有关，特别是在类类型的指针/引用的情况下。为了说明，这就是我想要的标准类型，并且它有效://.hintadd(constlongarg1,constlongarg2,long&resultLong);//interface.i%applylong&OUTPUT{long&resultLong};intadd(constlongarg1,constlongarg2,long&resultLong);//projectWrapper.pydefadd(arg1,arg2)
我正在使用python和tkinter制作一个GUI，只是想知道是否有办法让任何输出文本出现在GUI的窗口中而不是解释器/shell上？提前致谢 最佳答案 如果按照BryanOakley的评论中的建议，您想要“在您的GUI中打印‘foo’，但让它神奇地出现在文本小部件中”，请参阅上一个问题的答案Python:ConvertingCLItoGUI.这个答案解决了如何在文本框中生成输出这一更简单的问题。要生成滚动文本窗口，请创建并放置或打包一个文本小部件(我们称它为mtb)，然后使用像mtb.insert(Tkinter.END,ms)
我已经设法使用:dft=pd.DataFrame.from_dict({0:[50,45,00,00],1:[53,48,00,00],2:[56,53,00,00],3:[54,49,00,00],4:[53,48,00,00],5:[50,45,00,00]},orient='index')这样做，构造函数看起来就像DataFrame一样，易于阅读/编辑:>>>dft0123050450015348002565300354490045348005504500但是DataFrame.from_dictconstructor没有列参数，因此为列提供合理的名称需要一个额外的步骤:dft.
