一、质控前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件,现在需要对fastq文件进行质控,这里用的软件为fastqc。首先建好文件夹用来存放数据mkdir01raw02clean03alin04countfastqc1.pngR1=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_1.fastq.gzR2=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_2.fastq.gzfastqc$R1$R2这步会产生一个html文件,这就是fastqc的结果,我们可以双击在网页中打开进行查看。(详见下面介绍的fas
一、质控前面我们从GEO下好了SRA数据并转换为fastq文件,现在需要对fastq文件进行质控,这里用的软件为fastqc。首先建好文件夹用来存放数据mkdir01raw02clean03alin04countfastqc1.pngR1=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_1.fastq.gzR2=/mnt/d/bioinfo/project/rna/01raw/SRR15859344_2.fastq.gzfastqc$R1$R2这步会产生一个html文件,这就是fastqc的结果,我们可以双击在网页中打开进行查看。(详见下面介绍的fas
Errorggplot(Errorinseq.int(0,to0-from,by):'to'mustbefinite)为了用ggplot2绘制数据,我遇到了以下错误。可用的命令、数据和错误类型如下:123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445require(ggplot2)require(reshape2)dfdf[3]=c( "Normal", "Normal", "Normal", "Normal", "Normal", "Norma
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