机器学习：基于主成分分析（PCA）对数据降维作者：i阿极作者简介：Python领域新星作者、多项比赛获奖者：博主个人首页😊😊😊如果觉得文章不错或能帮助到你学习，可以点赞👍收藏📁评论📒+关注哦！👍👍👍📜📜📜如果有小伙伴需要数据集和学习交流，文章下方有交流学习区！一起学习进步！💪专栏案例：机器学习机器学习：基于逻辑回归对某银行客户违约预测分析机器学习：学习k-近邻（KNN）模型建立、使用和评价机器学习：基于支持向量机（SVM）进行人脸识别预测决策树算法分析天气、周末和促销活动对销量的影响机器学习：线性回归分析女性身高与体重之间的关系机器学习：基于朴素贝叶斯对花瓣花萼的宽度和长度分类预测机器学习：学
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《Python机器学习手册——从数据预处理到深度学习》这本书类似于工具书或者字典，对于python具体代码的调用和使用场景写的很清楚，感觉虽然是工具书，但是对照着做一遍应该可以对机器学习中python常用的这些库有更深入的理解，在应用中也能更为熟练。以下是根据书上的代码进行实操，注释基本写明了每句代码的作用(写在本句代码之前)和print的输出结果（写在print之后）。不一定严格按照书上内容进行，根据代码运行时具体情况稍作顺序调整，也加入了一些自己的理解。如果复制到自己的环境下跑一遍输出，相信理解会更深刻更清楚。博客中每个代码块代表一次完整的运行结果，可以直接以此为单位复制并运行。04-处理
《Python机器学习手册——从数据预处理到深度学习》这本书类似于工具书或者字典，对于python具体代码的调用和使用场景写的很清楚，感觉虽然是工具书，但是对照着做一遍应该可以对机器学习中python常用的这些库有更深入的理解，在应用中也能更为熟练。以下是根据书上的代码进行实操，注释基本写明了每句代码的作用(写在本句代码之前)和print的输出结果（写在print之后）。不一定严格按照书上内容进行，根据代码运行时具体情况稍作顺序调整，也加入了一些自己的理解。如果复制到自己的环境下跑一遍输出，相信理解会更深刻更清楚。博客中每个代码块代表一次完整的运行结果，可以直接以此为单位复制并运行。04-处理
2.特征工程2.1数据集2.1.1可用数据集Kaggle网址：https://www.kaggle.com/datasetsUCI数据集网址：http://archive.ics.uci.edu/ml/scikit-learn网址：http://scikit-learn.org/stable/datasets/index.html#datasets2.1.2安装scikit-learn工具pip3installScikit-learn==0.19.1安装好之后可以通过以下命令查看是否安装成功importsklearn注：安装scikit-learn需要Numpy,Scipy等库分类、聚类、回归
2.特征工程2.1数据集2.1.1可用数据集Kaggle网址：https://www.kaggle.com/datasetsUCI数据集网址：http://archive.ics.uci.edu/ml/scikit-learn网址：http://scikit-learn.org/stable/datasets/index.html#datasets2.1.2安装scikit-learn工具pip3installScikit-learn==0.19.1安装好之后可以通过以下命令查看是否安装成功importsklearn注：安装scikit-learn需要Numpy,Scipy等库分类、聚类、回归
关于“数据的维度”(dims参数)的选择完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成分进行下游分析呢？主要参考以下方法：热图DimHeatmap(pbmc,dims=1:15,cells=500,balanced=TRUE)image.png如上图所示，可以看出前15个主成分可以把细胞分成差异明显的两群，说明前15个主成分中含有的显著的差异基因更多，主成分也就更有意义，所以下游分析可以纳入前15个PCs。碎石图ElbowplotElbowPlot(pbmc)通过碎石图可以看出每个PC对变异的贡献情况，从上图可以看出9~10PC以后逐渐趋于稳定（噪声主
关于“数据的维度”(dims参数)的选择完成PCA之后，我们获得了该数据集的所有主成分（PCs）信息，但是如何决定纳入多少个主成分进行下游分析呢？主要参考以下方法：热图DimHeatmap(pbmc,dims=1:15,cells=500,balanced=TRUE)image.png如上图所示，可以看出前15个主成分可以把细胞分成差异明显的两群，说明前15个主成分中含有的显著的差异基因更多，主成分也就更有意义，所以下游分析可以纳入前15个PCs。碎石图ElbowplotElbowPlot(pbmc)通过碎石图可以看出每个PC对变异的贡献情况，从上图可以看出9~10PC以后逐渐趋于稳定（噪声主
前言主成分分析(PrincipalComponentsAnalysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示，可用于提取数据的主要特征分量，常用于高维数据的降维。这种降维的思想首先减少数据集的维数，同时还保持数据集的对方差贡献最大的特征，最终使数据直观呈现在二维坐标系。数据降维展示直观上，第一主成分轴优于第二主成分轴，具有最大可分性。主坐标分析（PrincipalCoordinatesAnalysis，PCoA），即经典多维标度（Classicalmultidimensionalscaling），用于
前言主成分分析(PrincipalComponentsAnalysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示，可用于提取数据的主要特征分量，常用于高维数据的降维。这种降维的思想首先减少数据集的维数，同时还保持数据集的对方差贡献最大的特征，最终使数据直观呈现在二维坐标系。数据降维展示直观上，第一主成分轴优于第二主成分轴，具有最大可分性。主坐标分析（PrincipalCoordinatesAnalysis，PCoA），即经典多维标度（Classicalmultidimensionalscaling），用于
