1.创建物化视图altersessionsetcontainer=pdb;grantcreatematerializedviewtoscott;创建语法解释1."创建build"的方式(1)'immediate':立即生效,默认。(2)'deferred':延迟至第一次refresh时才生效2."刷新refresh"的方式(1)force:默认。如果可以'快速刷新'就'快速刷新',否则执行'完全刷新'(2)fast:'快速刷新'。只刷新'增量'部分(前提:创建'物化日志')(3)complete:'完全刷新'。刷新时更新全部数据,包括视图中已经生成的原有数据(4)never:从不刷新3."触发
前言我又重新回到了微生物研究领域了,现在特别想写一个适合自己的微生物数据分析的R包,于是昨天开始写了。架构和我先前写的MyRtools包类似的架构,只是内容增加了很多。暂时实现功能(Vignettes效果图)PERMANOVA比如很多人邮件我关于PERMANOVA代码,现在MicrobiomeAnalysis提供了完整的函数,大家直接调用就可以啦。PS:不过对输入数据的格式有要求.GitHub仓库MicrobiomeAnalysis,大家可以到这里https://github.com/HuaZou/MicrobiomeAnalysis/releases下载已经编译好的包。进展Different
前言我又重新回到了微生物研究领域了,现在特别想写一个适合自己的微生物数据分析的R包,于是昨天开始写了。架构和我先前写的MyRtools包类似的架构,只是内容增加了很多。暂时实现功能(Vignettes效果图)PERMANOVA比如很多人邮件我关于PERMANOVA代码,现在MicrobiomeAnalysis提供了完整的函数,大家直接调用就可以啦。PS:不过对输入数据的格式有要求.GitHub仓库MicrobiomeAnalysis,大家可以到这里https://github.com/HuaZou/MicrobiomeAnalysis/releases下载已经编译好的包。进展Different
image.png变量显示变量值:echo$变量名变量名之前一定要有$符号,echo才能将变量名替换成实际变量值。PATH存放命令的查找方式,类似快捷方式。which查看命令的位置。系统级配置文件:/etc/profile用户配置文件:~/.bashrc查看linux常见命令:man.linux【linux命令大全】windows下查看环境变量:我的电脑-属性-高级系统设置正式安装软件1.Root安装2.Conda安装小炒:搜索“condacheatsheet”好处:第三方软件齐全,安装方便。多环境管理,避免软件冲突。不需要root权限,可自由安装软件。添加channelchannel是有顺序
image.png变量显示变量值:echo$变量名变量名之前一定要有$符号,echo才能将变量名替换成实际变量值。PATH存放命令的查找方式,类似快捷方式。which查看命令的位置。系统级配置文件:/etc/profile用户配置文件:~/.bashrc查看linux常见命令:man.linux【linux命令大全】windows下查看环境变量:我的电脑-属性-高级系统设置正式安装软件1.Root安装2.Conda安装小炒:搜索“condacheatsheet”好处:第三方软件齐全,安装方便。多环境管理,避免软件冲突。不需要root权限,可自由安装软件。添加channelchannel是有顺序
生信软件、流程依赖的东西太多,docker打包镜像一不小心就是上Gb大小。镜像太大很多缺点:上传、拉取慢;费宽带;占空间。。。docker已广泛应用在IT,生信只是沾了点光,所以没有专门的优化,在这方面的资料也比较少(尤其是中文)。这里贴几点资源,供参考。常见生信软件的docker镜像及其dockerfileBioinformaticsDockerImagesProjectBioinformaticsDockerImagesProjecthttps://pegi3s.github.io/dockerfiles/由PhenotypicEvolutionGroup-IBMC/i3S团队维护。所有镜
生信软件、流程依赖的东西太多,docker打包镜像一不小心就是上Gb大小。镜像太大很多缺点:上传、拉取慢;费宽带;占空间。。。docker已广泛应用在IT,生信只是沾了点光,所以没有专门的优化,在这方面的资料也比较少(尤其是中文)。这里贴几点资源,供参考。常见生信软件的docker镜像及其dockerfileBioinformaticsDockerImagesProjectBioinformaticsDockerImagesProjecthttps://pegi3s.github.io/dockerfiles/由PhenotypicEvolutionGroup-IBMC/i3S团队维护。所有镜
1了解conda,anaconda,miniconda,bioconda套娃1.1condaconda是一个软件模块管理工具,也是一个可执行命令,其核心功能是包管理与环境管理,可以用来管理Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,JavaScript,C/C++,FORTRAN等语言的模块。在python中使用比较多,有点类似于pip工具。conda的用途:快速安装、运行和升级包及其依赖项在计算机中便捷地创建、保存、加载和切换环境1.2anacondaanaconda是一个开源的Python发行版本,包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项。Anaconda具
1了解conda,anaconda,miniconda,bioconda套娃1.1condaconda是一个软件模块管理工具,也是一个可执行命令,其核心功能是包管理与环境管理,可以用来管理Python,R,Ruby,Lua,Scala,Java,JavaScript,C/C++,FORTRAN等语言的模块。在python中使用比较多,有点类似于pip工具。conda的用途:快速安装、运行和升级包及其依赖项在计算机中便捷地创建、保存、加载和切换环境1.2anacondaanaconda是一个开源的Python发行版本,包含了conda、Python等180多个科学包及其依赖项。Anaconda具
1.术语定义物化视图:将视图的查询结果物化保存下来的结果。物化视图QueryRel:生成物化视图的SQL关系表达式(查询语句)。物化视图TableRel:生成物化视图结果存储的关系表达式(存储物化视图的tableScan算子)。COMPLETE:查询表模型和物化视图表模型完全相同,比如查询引用了a,b,c三张表,物化视图也引用了a,b,c三张表。VIEW_PARTIAL:查询表模型完全包含物化视图表模型,比如查询引用了a,b,c三张表,物化视图也引用了a,b两张表。QUERY_PARTIAL:物化试图表模型完全包含查询表模型,比如查询引用了a,b两张表,物化视图引用了a,b,c三张表。2.背景