草庐IT

流式细胞仪生物信息学CRO丨Cytapex功能简介

51component技术交流 2023-03-28 原文

Cytapex的自动化解决方案可以根据客户的细胞分析需求量身定制,速度快(60秒),并提供可靠、可重复的结果。

 

 

解决方案

01、质量检查

使用Cytapex的自动化方法,数据QC本身。Cytapex将检查纳入门控流程,以确保FCS文件在内部保持一致,与患者文件匹配,并且所有需要填写的报告都正确完成。这一切都基于确保Cytapex提供的数据具有正确的元数据。当然,垃圾进垃圾出对于自动分析与手动分析一样重要。

因此,Cytapex确保通道的命名一致且正确,使用性能更好的自动时间与荧光门控算法,并提供交互式、门控后报告标记变量和可疑数据。

 

02、自动门控

Cytapex的自动门控管道在世界上经过同行评审,并在生产中用于临床试验数据分析。它们为每个面板协同定制,以数据驱动的方式重现您的门控层次结构。

事实证明,Cytapex的管道在各个中心、疾病、仪器和时间方面都很稳健,并且可以无缝集成到涉及当前用于手动分析的商业软件的现有工作流程中。

 

03、生物标志物发现

无监督分析有很多选择,但是如果目标也是生成可报告数据(例如,细胞群比例),无监督方法缺乏定制的门控管道所具有的性能。

一旦这些管道到位,Cytapex就会结合所有可能的门组合来生成生物标志物,这种方式已经证明了世界级的性能,同时基于您已经签署的门。

 

04、透明实施

Cytapex可以将自动门控结果导出为您已经使用的格式,例如 FlowJo 和(即将推出)FCS Express。您甚至不必抬起手指就可以进行门控,只需将您的 FCS 文件放入一个文件夹中,管道就会从那里获取它。Cytapex生成定制的 PDF 报告,填写您的可报告文件,并将结果后处理为您需要的格式,因此不再需要复制和粘贴。

Cytapex为您提供源代码并提供多种实现选项,包括内部 Intranet Web 驱动接口、FlowJo 插件和制药安全 Singularity 容器。这些容器在高性能计算 (HPC) 环境中提供直接部署,需要假设用户和软件都缺乏信任。它们还提供了一种可靠的方法来重现您的数据分析。

 

05、更好的性能

Cytapex的工作流程利用了Cytapex内部开发的算法,并且一直被同行评审为性能更佳和更先进的算法(PMC3906045、PMC4874734、PMC4748244)。Cytapex对所有常用的自动化分析方法也有经验。

 

 

生物信息学服务

Cytapex为细胞计数数据设计定制的自动化数据分析管道,为客户提供快速、可靠和可重复的数据驱动结果。

在过去的17年中,Cytapex的团队涵盖了自动流式细胞仪数据分析的范围。从涉及 10,000 多个样本的 7 个小组临床试验、在整个基因组的 77,000 个文件中寻找生物标志物的小鼠研究、小型患者研究到仪器 QC,Cytapex已经看到了几乎所有类型的流式细胞术数据集。

Cytapex提供扩展和单一的生物信息学服务以满足您的需求。

Cytapex还拥有用于自动分析流量的所有常用工具的经验,并将我们的分析方法应用于广泛的研究和临床试验数据。

 

01、质量控制

Cytapex在生成您的结果,并且Cytapex确保我们报告的内容正确报告、QC 正确并且Cytapex已经确定了看起来不正确的样本。

 

02、自动门控

Cytapex的自动门控管道是为每个客户协作定制的,以可靠地重现您现有的门控层次结构。一旦设计了管道,Cytapex的门将使用强大的、可重复的框架为每个样本进行自我调整,然后为每个面板进一步手工制作,以通过算法捕获门控层次结构中的每个群体。

从那时起,您所需要提供的只是补偿FCS文件到您在内部运行的软件。您会在每幅图中看到门后的数学运算,让您对结果充满信心。

 

03、生物标志物发现

在生物标志物发现方面有很多选择。Cytapex将与您一起为您的数据和问题确定生物标志物发现的更好的方法。

 

 

Cytapex的客户

1、前10名制药公司中的6家

2、顶级仪器供应商

3、顶级试剂制造商

4、最大的CRO

5、小型生物技术

6、从事基础研究的学术实验室

7、测试服务提供商

 

有关流式细胞仪生物信息学CRO丨Cytapex功能简介的更多相关文章

  1. ruby-on-rails - Cucumber 是否只是 rspec 的包装器以帮助将测试组织成功能? - 2

    只是想确保我理解了事情。据我目前收集到的信息,Cucumber只是一个“包装器”,或者是一种通过将事物分类为功能和步骤来组织测试的好方法,其中实际的单元测试处于步骤阶段。它允许您根据事物的工作方式组织您的测试。对吗? 最佳答案 有点。它是一种组织测试的方式,但不仅如此。它的行为就像最初的Rails集成测试一样,但更易于使用。这里最大的好处是您的session在整个Scenario中保持透明。关于Cucumber的另一件事是您(应该)从使用您的代码的浏览器或客户端的角度进行测试。如果您愿意,您可以使用步骤来构建对象和设置状态,但通常您

  2. HBase Region 简介和建议数量&大小 - 2

    Region是HBase数据管理的基本单位,region有一点像关系型数据的分区。region中存储这用户的真实数据,而为了管理这些数据,HBase使用了RegionSever来管理region。Region的结构hbaseregion的大小设置默认情况下,每个Table起初只有一个Region,随着数据的不断写入,Region会自动进行拆分。刚拆分时,两个子Region都位于当前的RegionServer,但处于负载均衡的考虑,HMaster有可能会将某个Region转移给其他的RegionServer。RegionSplit时机:当1个region中的某个Store下所有StoreFile

  3. ruby-on-rails - rails 功能测试 - 2

    在Rails自动生成的功能测试(test/functional/products_controller_test.rb)中,我看到以下代码:classProductsControllerTest我的问题是:方法调用products()在哪里/如何定义?products(:one)到底是什么意思?看代码,大概意思是“创建一个产品”,但是它是如何工作的呢?注意我是Ruby/Rails的新手,如果这些是微不足道的问题,我深表歉意。 最佳答案 如果您查看test/fixtures文件夹,您会看到一个products.yml文件。这是在您创建

  4. ruby-on-rails - 功能测试 Authlogic? - 2

    在我的一些Controller中,我有一个before_filter检查用户是否登录?用于CRUD操作。application.rbdeflogged_in?unlesscurrent_userredirect_toroot_pathendendprivatedefcurrent_user_sessionreturn@current_user_sessionifdefined?(@current_user_session)@current_user_session=UserSession.findenddefcurrent_userreturn@current_userifdefine

  5. ruby - Ruby 中允许 "p *1..10"打印出数字 1-10 的功能是什么? - 2

    require'pp'p*1..10这会打印出1-10。为什么这么简洁?您还可以用它做什么? 最佳答案 它是“splat”运算符。它可用于分解数组和范围并在赋值期间收集值。这里收集赋值中的值:a,*b=1,2,3,4=>a=1b=[2,3,4]在此示例中,内部数组([3,4])中的值被分解并收集到包含数组中:a=[1,2,*[3,4]]=>a=[1,2,3,4]您可以定义将参数收集到数组中的函数:deffoo(*args)pargsendfoo(1,2,"three",4)=>[1,2,"three",4]

  6. ruby - 现代计算机的功能是否不足以处理字符串而无需使用符号(在 Ruby 中) - 2

    我读过的关于Ruby符号的每一篇文章都在谈论符号相对于字符串的效率。但是,这不是1970年代。我的电脑可以处理一些额外的垃圾收集。我错了吗?我拥有最新最好的奔腾双核处理器和4GBRAM。我认为这应该足以处理一些字符串。 最佳答案 您的计算机可能能够处理“一点点额外的垃圾收集”,但是当“一点点”发生在运行数百万次的内部循环中时呢?如果它在内存有限的嵌入式系统上运行呢?有很多地方你可以随意使用字符串,但在某些地方你不能。这完全取决于上下文。 关于ruby-现代计算机的功能是否不足以处理字符串

  7. ruby - 如何在 Cucumber 的功能名称中使用空格 - 2

    我正在使用Windows并尝试运行一个现有的功能包,该功能包最初是在MacOS上构建的,这允许他们通过使用带空格的"\"来解决问题。我正在使用Ruby2.2.3和Cucumber。功能名称包含空格,我无法更改它。我尝试使用""和''来绕过空白,但每次都有同样的问题。这是问题的一个例子。如果我运行:cucumberfeatures/'Namecontainingwhitespaces.feature'它工作正常。但是当我运行时:cucumber-pmy_profile和cucumber.yml包含:my_profile:features/'Namecontainingwhitespace

  8. ruby - 如何测试在运行之间提供功能的 Ruby 脚本? - 2

    单元测试的好方法是测试脚本在执行之间保持正确数据的能力——在使用Ctrl-C终止脚本然后重新运行之后?是否有针对执行类似操作的现有模块或脚本的任何测试可以针对最佳实践进行审查? 最佳答案 像http://avdi.org/devblog/2010/07/19/greenletters-painless-automation-and-testing-for-command-line-applications/一样使用库或者期望、运行、终止并重新运行您的程序,并检查它是否运行正确。好的做法是将程序设计为独立的模块,每个模块都经过良好测试

  9. ruby - 带有 header 的 Sinatra 流式响应 - 2

    我想通过Sinatra应用程序代理远程文件。这需要将带有header的HTTP响应从远程源流式传输回客户端,但我不知道如何在Net::HTTP#提供的block内使用流式API时设置响应header获取响应。例如,这不会设置响应头:get'/file'dostreamdo|out|uri=URI("http://manuals.info.apple.com/en/ipad_user_guide.pdf")Net::HTTP.get_response(uri)do|file|headers'Content-Type'=>file.header['Content-Type']file.re

  10. ruby - 使用 Ruby 将 HTTP GET 的响应主体流式传输到 HTTP POST - 2

    我正在尝试下载一个大文件,然后使用Ruby将该文件发布到REST端点。该文件可能非常大,即超过可以存储在内存中甚至磁盘上的临时文件中的容量。我一直在用Net::HTTP尝试这个,但我愿意接受任何其他库(rest-client等)的解决方案,只要他们做我想做的事情。这是我尝试过的:require'net/http'source_uri=URI("https://example.org/very_large_file")source_request=Net::HTTP::Get.new(source_uri)source_http=Net::HTTP.start(source_uri.ho

随机推荐