导读:本文由香港中文大学James Cheng教授团队贡献,James Cheng教授长期从事分布式系统、分布式计算、图计算与图数据管理等方向的研究工作。曾与阿里巴巴、华为、腾讯、字节跳动等多家公司在大数据计算系统、存储系统、调度系统、深度学习系统等方向上展开项目合作,曾获得香港青年科学家称号,ATC'21最佳论文奖。接下来,大家一起来了解下图数据库技术发展的前世今生吧:
图片来源自:https://k21academy.com/dba-to-cloud-dba/nosql-database-service-in-oracle-cloud/从大约2010年开始,各种构建于NoSQL体系或者关系型数据库之上的图数据库便涌现而出,比如:Titan, JanusGraph, RedisGraph, Sparksee, AgensGraph, OrientDB 等等, 当然同一时间也出现了Neo4j这种为图数据而专门设计的图原生存储数据库,其现今已经发展成为了图数据库领域商业化的领头羊。我们下面将根据存储模型的不同对这些图数据库做一个简单的归类和讨论。但由于篇幅有限,详细的分析和性能对比不会在本文展开,我们今后将会在arXiv上提交一篇Experimental Track的学术论文来系统性地分析这些图数据库的设计方案和性能测试报告。
图1 - Neo4j的存储模型图2说明了Neo4j如何将所有记录存储在磁盘上。我们可以看到,每条记录都有自己固定大小的块,相同类型的记录被连续地存储在一起,形成一张表。因此,表中的每条记录都可以根据其偏移量进行有效定位,其中偏移量是根据记录的ID计算的。对于属性值,如果它的长度大于一个记录块的默认长度,那么Neo4j将把这个属性值的超出部分存储在另一个由若干固定大小的槽组成的分离数据块中。
图2 - Neo4j不同类型的数据记录在磁盘上的组织形式
图3 - RedisGraph的存储Layout设计
图4:Sparksee中的值集与位图
图5 - AgensGraph中图数据在Table中以页的方式的存储格式
图6 - OrientDB的数据存储格式
图7 - JanusGraph的图数据存储格式
接下来,本文将盘点近几年有代表性的若干个现代图数据库的架构设计,简单讲解下图数据库2.0时代对高可用性和高性能的业界实现方案。
图8 - NebulaGraph的系统架构图片来源自:https://www.nebula-graph.com.cn/posts/nebula-graph-architecture-overviewMeta Service集群基于raft协议保证了数据的一致性和高可用。Meta Service不仅负责存储和提供图数据的meta信息,如schema、partition信息等,还同时负责指挥数据迁移及 leader 的变更等运维操作。左侧主要服务采用了存储与计算分离的架构,虚线以上为计算,以下为存储。计算层和存储层可以根据各自的情况弹性扩容、缩容,也使水平扩展成为可能。此外,存储计算分离使得 Storage Service 可以为多种类型的计算层或者计算引擎提供服务。Nebula的每个计算节点都运行着一个无状态的查询计算引擎,而节点彼此间无任何通信关系。计算节点从Meta Service读取meta信息然后将请求发送到对应的Storage Service实例上。这样设计使得计算层更容易使用 K8s 管理或部署在云上。每个查询计算引擎都能接收客户端的请求,解析查询语句,生成抽象语法树(AST)并将 AST 传递给执行计划器和优化器,最后再交由执行器执行。Storage Service采用shared-nothing的分布式架构设计,每个存储节点都有多个本地 KV 存储实例作为物理存储。Nebula同样用Raft来保证这些 KV 存储之间的一致性,并在KV语义之上封装了一层图语义层,用于将图操作转换为下层的KV操作。图数据(点和边)通过Hash的方式存储在不同Partition中,这些Partition分布在所有的存储节点上,分布信息则存储在Meta Service中。
图9 - ByteGraph的系统架构图片来源自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/109401046ByteGraph的查询层同样没有状态,可以水平扩容,主要工作是做读写请求的解析和处理(将数据请求基于一致性哈希规则分发给存储层实例并收集返回的请求结果)。内存存储层的实现和功能有点类似内存数据库,提供高性能的数据读写功能,具体提供点边的读写接口并支持算子下推:通过把计算(算子)移动到存储层实例上执行,以有效提升读性能。内存存储层整体上作为了磁盘存储层的缓存,提供缓存管理的功能,支持缓存加载、换出、缓存和磁盘同步异步sync等功能。磁盘存储层是一个单独部署的分布式键值对存储服务,将图数据以KV pairs的形式持久化存储在磁盘上。ByteGraph针对热点数据访问做了自己的存储优化,从系统角度当然希望存储在KVS中的KV pairs大小控制在KB量级且大小均匀。其将顶点的所有出度邻居平均拆分成多个KV对,所有KV对形成一棵逻辑上的B-Tree,数据结构如下图所示。值得一提的是,ByteGraph在今年的VLDB'22 Industrial Track上发表了一篇论文,对其设计动机和性能分析都做了比较详细的描述,具体可参考论文地址:https://vldb.org/pvldb/vol15/p3306-li.pdf
图片来源自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/109401046
图片来源自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/450584880EasyGraph整体上采用存储计算分离架构,在KV存储组件上适配了开源的TiKV及内部分布式KV;TiKV基于rocksdb实现了分区和副本管理,并在TiDB上有成熟的解决方案,适配TiKV可以实现存储层的可扩展性,TiKV基于Raft算法实现了数据多副本之间的一致性。EasyGraph也自研了图可视化分析引擎,在可视化效果及规模上都有明显的提升,支持几十万级点边渲染分析,以及用户级灵活的布局展示和可视化分析。EasyGraph也支持AngelGraph图计算引擎,其包括几十种传统图算法、Embedding及GNN算法,如社区发现、标签传播、随机游走等算法,这些算法进一步提升对图数据的挖掘分析能力。
图片来源自:https://neo4j.com/docs/operations-manual/current/clustering/introduction/Neo4j通过Primary Mode将一份数据备份到多个servers上并通过raft协议来保证一致性。与之相对应地,一次写入需要保证至少在(N/2+1)个副本上写成功才可以返回成功,因此在primary mode下服务实例数量越多,写性能就越差。而为了实现可扩展性,Neo4j也支持了Secondary mode,即支持对多个只读副本的部署以提高集群整体的读能力,只读副本是功能齐全的Neo4j数据库,能够完成任意(只读)图数据查询和过程。只读副本是通过事务日志shipping来完成对主副本的数据异步同步的。Neo4j也支持了数据科学(Graph Data Science)库,其包含了许多图分析算法,比如社区发现,路径搜索等,甚至也支持了少量的图神经网络算法(比如GraphSage, Node2Vec)。这些算法统一集成在了Neo4j的Cypher语言体系下,以提供给用户统一的图查询/图分析体验。
图片来源自:https://docs.tigergraph.com/tigergraph-server/current/intro/internal-architecture在OLTP功能上,TigerGraph支持完整的ACID特性,支持最高的serializability事务隔离级别。TigerGraph支持垂直扩展和水平扩展,且可以对集群中的图数据自动分区。从这点来看,TigerGraph对大规模图数据的存储支持得比Neo4j要友好很多。TigerGraph使用自定义的GSQL语言来表达查询逻辑,GSQL将SQL风格的查询语法与Cypher风格的图遍历语法结合在了一起,并支持用户自定义函数。我主要使用Ruby来执行此操作,但到目前为止我的攻击计划如下:使用gemsrdf、rdf-rdfa和rdf-microdata或mida来解析给定任何URI的数据。我认为最好映射到像schema.org这样的统一模式,例如使用这个yaml文件,它试图描述数据词汇表和opengraph到schema.org之间的转换:#SchemaXtoschema.orgconversion#data-vocabularyDV:name:namestreet-address:streetAddressregion:addressRegionlocality:addressLocalityphoto:i
有时我需要处理键/值数据。我不喜欢使用数组,因为它们在大小上没有限制(很容易不小心添加超过2个项目,而且您最终需要稍后验证大小)。此外,0和1的索引变成了魔数(MagicNumber),并且在传达含义方面做得很差(“当我说0时,我的意思是head...”)。散列也不合适,因为可能会不小心添加额外的条目。我写了下面的类来解决这个问题:classPairattr_accessor:head,:taildefinitialize(h,t)@head,@tail=h,tendend它工作得很好并且解决了问题,但我很想知道:Ruby标准库是否已经带有这样一个类? 最佳
我正在尝试使用Curbgem执行以下POST以解析云curl-XPOST\-H"X-Parse-Application-Id:PARSE_APP_ID"\-H"X-Parse-REST-API-Key:PARSE_API_KEY"\-H"Content-Type:image/jpeg"\--data-binary'@myPicture.jpg'\https://api.parse.com/1/files/pic.jpg用这个:curl=Curl::Easy.new("https://api.parse.com/1/files/lion.jpg")curl.multipart_form_
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本教程将在Unity3D中混合Optitrack与数据手套的数据流,在人体运动的基础上,添加双手手指部分的运动。双手手背的角度仍由Optitrack提供,数据手套提供双手手指的角度。 01 客户端软件分别安装MotiveBody与MotionVenus并校准人体与数据手套。MotiveBodyMotionVenus数据手套使用、校准流程参照:https://gitee.com/foheart_1/foheart-h1-data-summary.git02 数据转发打开MotiveBody软件的Streaming,开始向Unity3D广播数据;MotionVenus中设置->选项选择Unit
文章目录一、概述简介原理模块二、配置Mysql使用版本环境要求1.操作系统2.mysql要求三、配置canal-server离线下载在线下载上传解压修改配置单机配置集群配置分库分表配置1.修改全局配置2.实例配置垂直分库水平分库3.修改group-instance.xml4.启动监听四、配置canal-adapter1修改启动配置2配置映射文件3启动ES数据同步查询所有订阅同步数据同步开关启动4.验证五、配置canal-admin一、概述简介canal是Alibaba旗下的一款开源项目,Java开发。基于数据库增量日志解析,提供增量数据订阅&消费。Git地址:https://github.co
我正在尝试在Rails上安装ruby,到目前为止一切都已安装,但是当我尝试使用rakedb:create创建数据库时,我收到一个奇怪的错误:dyld:lazysymbolbindingfailed:Symbolnotfound:_mysql_get_client_infoReferencedfrom:/Library/Ruby/Gems/1.8/gems/mysql2-0.3.11/lib/mysql2/mysql2.bundleExpectedin:flatnamespacedyld:Symbolnotfound:_mysql_get_client_infoReferencedf
文章目录1.开发板选择*用到的资源2.串口通信(个人理解)3.代码分析(注释比较详细)1.主函数2.串口1配置3.串口2配置以及中断函数4.注意问题5.源码链接1.开发板选择我用的是STM32F103RCT6的板子,不过代码大概在F103系列的板子上都可以运行,我试过在野火103的霸道板上也可以,主要看一下串口对应的引脚一不一样就行了,不一样的就更改一下。*用到的资源keil5软件这里用到了两个串口资源,采集数据一个,串口通信一个,板子对应引脚如下:串口1,TX:PA9,RX:PA10串口2,TX:PA2,RX:PA32.串口通信(个人理解)我就从串口采集传感器数据这个过程说一下我自己的理解,
SPI接收数据左移一位问题目录SPI接收数据左移一位问题一、问题描述二、问题分析三、探究原理四、经验总结最近在工作在学习调试SPI的过程中遇到一个问题——接收数据整体向左移了一位(1bit)。SPI数据收发是数据交换,因此接收数据时从第二个字节开始才是有效数据,也就是数据整体向右移一个字节(1byte)。请教前辈之后也没有得到解决,通过在网上查阅前人经验终于解决问题,所以写一个避坑经验总结。实际背景:MCU与一款芯片使用spi通信,MCU作为主机,芯片作为从机。这款芯片采用的是它规定的六线SPI,多了两根线:RDY和INT,这样从机就可以主动请求主机给主机发送数据了。一、问题描述根据从机芯片手