论文Theslow-evolvingAcorustatarinowiigenomeshedslightonancestralmonocotevolutionhttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01187-x#Sec21本地pdfs41477-022-01187-x.pdf论文中的数据基本都公开了，我们可以利用论文中的数据模仿论文中的图，今天的推文模仿一下论文中Figure1c和figure1fimage.pngfigure1c部分示例数据截图image.png读取数据并作图library(readxl)datf3c%select(-'4dTV_
论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure2aimage.png主要知识点如何在山脊图上添加辅助线另外一个知识点是如何把图例放到整个图的左下角部分示例数据截图image.png读取数据library(readxl)dat.fig2a数据转换为长格式libr
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.10image.png论文中做数据计算和做这个图定义了一个很长很长的函数，这里只介绍作图代码，数据计算的过程我还看不懂这里主要有两个数据，一个是热图
论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.com/PlantNutrition/Liyu今天的推文我们重复一下论文中的Figure2eimage.png关于平滑曲线，之前的推文有过介绍，可以参考我们看下这个论文里是用什么代码来实现的示例数据集
本期内容为[跟着NC学作图|柱状图与相关性图]本期文章是发表在NC期刊，题目为：Genome-centricanalysisofshortandlongreadmetagenomesrevealsuncharacterizedmicrobiomediversityinSoutheastAsians.本文作者提供了分析的代码和绘制图形的代码。绘图的代码是使用python。对于初学者来说也是比较友好的，自己也是学习Python的态度进行分享。绘图Figure1B##数据分析sdf=df[~df['genus'].isnull()]sdf=sdf.groupby('assembly')['genus
论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.pdf代码链接https://zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzichttps://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/
论文MiDAS4:Aglobalcatalogueoffull-length16SrRNAgenesequencesandtaxonomyforstudiesofbacterialcommunitiesinwastewatertreatmentplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7数据链接https://figshare.com/articles/dataset/Dueholm2021a_data_zip/16566408/1代码链接https://github.com/msdueholm/MiDAS4今天的推文我们重复
论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.3cimage.png他这个图的数据是怎么算出来的我还有点搞不明白，它的图注的内容也没有看明白Genepairsplottedaccordingtolog2f
大年三十晚上全程看完了春晚，虽然节目很烂，还是全程坚持看完了，《国色》那个节目还是很惊艳的，如果去掉唱歌的环节，可以给打十分。今天的推文我们把其中的配色摘下来，可以试着用在我们科研数据可视化中。沉香.jpg凝脂.jpg群青.jpg桃红.jpg缃叶.jpg以上图片截取自央视频颜色截取下来cols作图代码library(ggplot2)library(extrafont)fonts()datimage.png示例代码可以给推文点赞，点击在看，最后留言欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物
论文Single-cellprofilingofvascularendothelialcellsrevealsprogressiveorgan-specificvulnerabilitiesduringobesityhttps://www.nature.com/articles/s42255-022-00674-x#Sec58s42255-022-00674-x.pdfhttps://github.com/Osynchronika/sc_EC_obesity_atlas大部分作图的数据都有，可以试着用论文中提供的数据复现一下论文中的图今天的推文我们复现一下论文中的figure4fimage.p
