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从Scanpy的Anndata对象提取信息并转成Seurat对象(适用于空间组且涉及h5文件读写)2022-06-14

关键字Anndata对象转成Seurat对象h5文件读写空间组格式转换已补充快速使用的函数整理版本,如果不想看细节可以直接看已整理好的版本。适用背景众所周知,单细胞数据分析有两大软件:基于R语言的Seurat和基于Python的Scanpy,在平时的分析中常常需要把Seurat对象转成Scanpy的Anndata对象,这已经有比较成熟的流程了。但是,如果反过来把Anndata对象转成Seurat对象,网上搜到的方案寥寥无几,而且在本人亲测之下均报错无法成功实现。再加上我需要转的是空间组对象,结构比单细胞的更为复杂,只好自己想法从Anndata对象提取信息重新构建出一个Seurat对象了。这个步

Hbase_读写流程

Hbase架构图image.pngHbase写操作image.png执行put命令,put'namspace:table','rowkey','clonmu','value'1.客户端首先访问zookeeper,获取存储元数据meta表所在的ReginServer地址.2.客户端去访问该rs上的元数据,获取存储表的region分区所在的ReginServer地址.3.客户端到对应rs从节点,将数据存储到该节点,先存在memstore内image.png对于client来说,只需要将数据写入到memstore中就可以了,这也是Hbase快的原因4.habse会先将对数据的读写等操作记录到wal日

驱动开发:内核读写内存多级偏移

让我们继续在《内核读写内存浮点数》的基础之上做一个简单的延申,如何实现多级偏移读写,其实很简单,读写函数无需改变,只是在读写之前提前做好计算工作,以此来得到一个内存偏移值,并通过调用内存写入原函数实现写出数据的目的。以读取偏移内存为例,如下代码同样来源于本人的LyMemory读写驱动项目,其中核心函数为WIN10_ReadDeviationIntMemory()该函数的主要作用是通过用户传入的基地址与偏移值,动态计算出当前的动态地址。函数首先将基地址指向要读取的变量,并将其转换为LPCVOID类型的指针。然后将指向变量值的缓冲区转换为LPVOID类型的指针。接下来,函数使用PsLookupPr

16、Flink 的table api与sql之连接外部系统: 读写外部系统的连接器和格式以及FileSystem示例(1)

Flink系列文章1、Flink部署、概念介绍、source、transformation、sink使用示例、四大基石介绍和示例等系列综合文章链接13、Flink的tableapi与sql的基本概念、通用api介绍及入门示例14、Flink的tableapi与sql之数据类型:内置数据类型以及它们的属性15、Flink的tableapi与sql之流式概念-详解的介绍了动态表、时间属性配置(如何处理更新结果)、时态表、流上的join、流上的确定性以及查询配置16、Flink的tableapi与sql之连接外部系统:读写外部系统的连接器和格式以及FileSystem示例(1)20、FlinkSQL

用Python读写操作Excel数据!

对比其它编程语言,我们都知道Python最大的优势是代码简单,有丰富的第三方开源库供开发者使用。伴随着近几年数据分析的热度,Python也成为最受欢迎的编程语言之一。而对于数据的读取和存储,对于普通人来讲,除了数据库之外,最常见的就是微软的Excel。一、前期准备1.1初识ExcelMicrosoftExcel是Microsoft为使用Windows和AppleMacintosh操作系统的电脑编写的一款电子表格软件。1.2格式区别Excel中有xls和xlsx两种格式,它们之间的区别是:文件格式不同。xls是一个特有的二进制格式,其核心结构是复合文档类型的结构,而xlsx的核心结构是XML类型

android jni层 opencv读写视频,基于VideoCapture和VideoWriter

开始用正常c++的opencv代码,包括python代码,也都是直接用VideoCapture,在open后面加videofile就可以了 //readvideocv::VideoCapturecapture;capture.open("/storage/emulated/0/DCIM/test.mp4");但是在androidjni层无论读写视频,capture.open那里都会报错E/cv::error():OpenCV(4.6.0)Error:Requestedobjectwasnotfound(couldnotopendirectory:/data/app/~~sbu7r1TB_QJQ

Python读写csv文件

要在Python中写入CSV,请使用Python的csv模块。例如,让我们将一个字符串列表写入一个新的CSV文件:importcsvdata=["This","is","a","Test"]withopen('example.csv','w')asfile:writer=csv.writer(file)writer.writerow(data) 因此,您会在当前文件夹中看到一个名为example.csv的文件。用Python编写CSV的4个步骤要在Python中写入CSV文件:1.以写入模式打开CSV文件。这是使用open()函数发生的。给它文件的路径作为第一个参数。将模式指定为第二个参数(“

项目练习:构建读写分离的数据库集群

目录一、目标实现二、项目准备三、项目实施1.配置基础环境1.1修改主机名1.2配置3台群集虚拟机的/etc/hosts文件1.3.配置网卡1.4.配置本地yum源2.部署Mycat中间件服务2.1安装KDJ环境3.部署MariaDB主从数据库集群服务3.1安装MariaDB服务3.2初始化MariaDB数据库3.3配置数据库集群主节点3.4开放主节点的数据库权限3.5从节点同步主节点3.6验证主从数据库同步功能4部署Mycat读写分离中间件服务4.1安装Mycat服务4.2编辑Mycat逻辑库配置文件4.3编辑mycat的访问用户5验证集群服务读写分离5.1Mycat服务查询数据库信息5.2M

STM32软件模拟IIC---读写驱动AT24Cxx

以下内容皆是个人学习过程中的总结,记录一下整个过程,用于后期复习,如有不对之处,麻烦各位大佬指出~(喜欢的朋友麻烦点个关注~~~后期还会进行持续更新)概述 AT24C系列为美国ATMEL公司推出的串行COMS型E2PROM,是典型的串行通信E2PROM ,AT24CXX是IIC总线串行器件,具有工作电源宽(1.8~6.0 V),抗干扰能力强(输入引脚内置施密特触发器滤波抑制噪声),功耗低(写状态时最大工作电流3 mA),高可靠性(写次数100万次,数据保存100年),支持在线编程等特点.一、模拟IIC1.1、IIC简介IIC(Inter-IntegratedCircuit)总线是一种由PHIL

FPGA-ZCU106-PL侧读写ddr4(全网唯一)

1、由于一直在PL侧做算法,外设接口接触的比较少,目前只做了sfp的UDP传输,但是由于课题的原因需要将一部分PL计算数据存储,而RAM存储空间比较小,因此本次给大带来了ZCU106的PL侧读写ddr4的教程,本教程是全网ZCU106DDR4PL侧读写的唯一一篇教程。下面是4个参考资料:①:ZCU106开发之PL侧DDR4_lixiaolin126的博客-CSDN博客_zcu106开发板ddr4感谢大家漫长的等待!!我们团队从2017底拿到ZCU106后就一直在进行相关研发,由于手头上的活比较多就把ZCU106开发详解的发布给延迟了。现在我们将ZCU106开发过程中遇到的问题和解决办法跟大家进