论文Graphpangenomecapturesmissingheritabilityandempowerstomatobreedinghttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04808-9#MOESM8没有找到论文里的作图的代码，但是找到了部分组图数据，我们可以用论文中提供的原始数据模仿出论文中的图今天的推文重复一下论文中的Figure2aimage.png主要知识点如何在山脊图上添加辅助线另外一个知识点是如何把图例放到整个图的左下角部分示例数据截图image.png读取数据library(readxl)dat.fig2a数据转换为长格式libr
论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.10image.png论文中做数据计算和做这个图定义了一个很长很长的函数，这里只介绍作图代码，数据计算的过程我还看不懂这里主要有两个数据，一个是热图
论文Ahighlyconservedcorebacterialmicrobiotawithnitrogen-fixationcapacityinhabitsthexylemsapinmaizeplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-31113-w本地pdfs41467-022-31113-w.pdf数据代码链接https://github.com/PlantNutrition/Liyu今天的推文我们重复一下论文中的Figure2eimage.png关于平滑曲线，之前的推文有过介绍，可以参考我们看下这个论文里是用什么代码来实现的示例数据集
论文Apolarbearpaleogenomerevealsextensiveancientgeneflowfrompolarbearsintobrownbearshttps://www.nature.com/articles/s41559-022-01753-8image.png本地pdf文件Apolarbearpaleogenomerevealsextensiveancientgeneflowfrompolarbearsintobrownbears.pdf代码https://github.com/PopGenomics-WMS/Bruno_aDNA_analysishttps://gith
本期内容为[跟着NC学作图|柱状图与相关性图]本期文章是发表在NC期刊，题目为：Genome-centricanalysisofshortandlongreadmetagenomesrevealsuncharacterizedmicrobiomediversityinSoutheastAsians.本文作者提供了分析的代码和绘制图形的代码。绘图的代码是使用python。对于初学者来说也是比较友好的，自己也是学习Python的态度进行分享。绘图Figure1B##数据分析sdf=df[~df['genus'].isnull()]sdf=sdf.groupby('assembly')['genus
论文PlasmaproteomeanalysesinindividualsofEuropeanandAfricanancestryidentifycis-pQTLsandmodelsforproteome-wideassociationstudieshttps://www.nature.com/articles/s41588-022-01051-w本地pdfs41588-022-01051-w.pdf代码链接https://zenodo.org/record/6332981#.YroV0nZBzichttps://github.com/Jingning-Zhang/PlasmaProtein/
“0708：测试用例要保持最小依赖（jsonresult）”7月8号，作为一个小菜鸡给大领导用java写一个关于json的测试用例，结果我测试用例一提交，大领导更新下去之后，发现运行不了。然后就找着我了，一顿谆谆教诲来了。“……，你写测试用例可以参考以前的测试用例写法，保持最小的依赖，能说明问题就行，越简洁越好，我拿到能直接运行，这样我就不用去建库建表了。你测试用例的依赖的那个schema，那个json数据，虽然是最近我们一直在用的，但也不应该直接在测试用例里放着。不然以后这个测试用例，在别人电脑上执行怎么办呢？”牢记！（被大领导教导挺难得的，还是挺开心的）
论文MiDAS4:Aglobalcatalogueoffull-length16SrRNAgenesequencesandtaxonomyforstudiesofbacterialcommunitiesinwastewatertreatmentplantshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29438-7数据链接https://figshare.com/articles/dataset/Dueholm2021a_data_zip/16566408/1代码链接https://github.com/msdueholm/MiDAS4今天的推文我们重复
论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一下论文中的ExtendedDataFig.3cimage.png他这个图的数据是怎么算出来的我还有点搞不明白，它的图注的内容也没有看明白Genepairsplottedaccordingtolog2f
大年三十晚上全程看完了春晚，虽然节目很烂，还是全程坚持看完了，《国色》那个节目还是很惊艳的，如果去掉唱歌的环节，可以给打十分。今天的推文我们把其中的配色摘下来，可以试着用在我们科研数据可视化中。沉香.jpg凝脂.jpg群青.jpg桃红.jpg缃叶.jpg以上图片截取自央视频颜色截取下来cols作图代码library(ggplot2)library(extrafont)fonts()datimage.png示例代码可以给推文点赞，点击在看，最后留言欢迎大家关注我的公众号小明的数据分析笔记本小明的数据分析笔记本公众号主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物
