草庐IT

python: 计算RPKM

操作np.rot90(df,1)#矩阵,逆时针,90度np.rot90(df,-1)#矩阵,顺时针,90度矩阵/数组,使用循环速度特慢#!/usr/binpython3#-*-coding:UTF-8-*-importos,sys,reimportpandasaspddf=pd.read_csv("final.head",index_col=0,header=0,sep="\t")length=pd.read_csv("final.length",index_col=0,header=0,sep="\t")foriinrange(len(df.index)):forjinrange(len(d

linux - Grep 文件中的多个模式并为每个模式输出前 5 个匹配项

我有一个关于模式匹配的问题。我有一个包含多个模式的文件,比如pattern.txt轨迹3039v1rpkm6.85Locus3041v1rpkm6.84Locus3042v1rpkm6.84要搜索的测试文件是file.txt-Locus3039v1rpkm6.85gi|350401309|ref|XM_003486067.1|010853282538e-1278.8Locus3039v1rpkm6.85gi|350401301|ref|XM_003486066.1|010855664918e-1278.8Locus3039v1rpkm6.85gi|350401298|ref|XM_00

linux - Grep 文件中的多个模式并为每个模式输出前 5 个匹配项

我有一个关于模式匹配的问题。我有一个包含多个模式的文件,比如pattern.txt轨迹3039v1rpkm6.85Locus3041v1rpkm6.84Locus3042v1rpkm6.84要搜索的测试文件是file.txt-Locus3039v1rpkm6.85gi|350401309|ref|XM_003486067.1|010853282538e-1278.8Locus3039v1rpkm6.85gi|350401301|ref|XM_003486066.1|010855664918e-1278.8Locus3039v1rpkm6.85gi|350401298|ref|XM_00