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R : Any other solution to "cannot allocate vector size n mb" in R?

我的问题在于对大数据集(大约2500万行和10列,即大约1GB数据)的简单计算。我的系统是:32bits/Windows7/4GbRam/RStudio0.96,R2.15.2我可以使用BigMemory包来引用我的数据库。并在我的数据库上使用函数。我也可以使用ff包、filehash等来做到这一点。问题是在计算简单计算(如唯一值、平均值等)时,我遇到了典型的问题"cannotallocatevectorsizenmb",其中n可以小至70mb-95mb等。我知道到目前为止提供的所有(我认为)解决方案:increaseRAM.launchRwithinlinecode"--max-me

c++ - vector<unique_ptr> 使用 push_back 调整大小 - 它是如何工作的?

据我了解,当东西被push_back放入vector时,有时它必须分配一个新的内存块,导致将所有元素从旧内存块复制到其中,调用它们的析构函数。由于unique_ptr析构函数删除了拥有的内存,它们怎么可能与vector一起使用?在vector中使用unique_ptr是否安全?是不是比普通指针慢? 最佳答案 resultingincopyingalltheelementsintoitfromtheoldmemoryblock,callingtheirdestructors.Sinceunique_ptrdestructorsdele

c++ - vector<unique_ptr> 使用 push_back 调整大小 - 它是如何工作的?

据我了解,当东西被push_back放入vector时,有时它必须分配一个新的内存块,导致将所有元素从旧内存块复制到其中,调用它们的析构函数。由于unique_ptr析构函数删除了拥有的内存,它们怎么可能与vector一起使用?在vector中使用unique_ptr是否安全?是不是比普通指针慢? 最佳答案 resultingincopyingalltheelementsintoitfromtheoldmemoryblock,callingtheirdestructors.Sinceunique_ptrdestructorsdele

c++ - std::vector 元素在物理内存中是否连续?

我的问题类似于this,但是我问的有点不同。很明显,可以将第一个std::vector元素的地址用作C类型的数组。这意味着在虚拟内存中,std::vector元素是连续的。但是,如果物理内存是碎片化的,那么std::vector有可能实际上在物理内存中被分割成很多部分。我的问题是:std::vector元素在物理内存(以及虚拟内存)中是连续的吗? 最佳答案 用于将数据存储在vector中的内存必须位于连续地址,因为这些地址对代码可见。在大多数现代CPU/操作系统的典型情况下,这意味着虚拟地址必须是连续的。如果这些虚拟地址跨越页面边界

c++ - std::vector 元素在物理内存中是否连续?

我的问题类似于this,但是我问的有点不同。很明显,可以将第一个std::vector元素的地址用作C类型的数组。这意味着在虚拟内存中,std::vector元素是连续的。但是,如果物理内存是碎片化的,那么std::vector有可能实际上在物理内存中被分割成很多部分。我的问题是:std::vector元素在物理内存(以及虚拟内存)中是连续的吗? 最佳答案 用于将数据存储在vector中的内存必须位于连续地址,因为这些地址对代码可见。在大多数现代CPU/操作系统的典型情况下,这意味着虚拟地址必须是连续的。如果这些虚拟地址跨越页面边界

c++ - 调用exit时使用vector,c++不清楚内存泄漏

我正在调试我的程序,我注意到即使我已经标记了几乎所有它作为评论,我所做的只是将double值插入vector,我有内存泄漏。我在c++引用中阅读了api,但找不到任何东西。代码如下:#include#include#include#include"RegMatrix.h"#include"Matrix.h"usingnamespacestd;intmain(void){vectorv;for(inti=0;i还有valgrind的报告:==9299==HEAPSUMMARY:==9299==inuseatexit:128bytesin1blocks==9299==totalheapus

c++ - 调用exit时使用vector,c++不清楚内存泄漏

我正在调试我的程序,我注意到即使我已经标记了几乎所有它作为评论,我所做的只是将double值插入vector,我有内存泄漏。我在c++引用中阅读了api,但找不到任何东西。代码如下:#include#include#include#include"RegMatrix.h"#include"Matrix.h"usingnamespacestd;intmain(void){vectorv;for(inti=0;i还有valgrind的报告:==9299==HEAPSUMMARY:==9299==inuseatexit:128bytesin1blocks==9299==totalheapus

like模糊查询导致索引失效的解决方案

我们在使用like通配符有下面三种用法,其中第1和第2的用法会引起索引失效的问题。这是因为MySQL的索引是按照从左到右的顺序进行匹配的,而前导通配符(比如%abc)会导致无法按照索引顺序进行匹配。1、like'%name'  ——>失效2、like'%name%' ——>失效3、like'name%'现在来说下解决方案:1.为需要进行模糊查询的name字段增加一个联合索引,比如name和age 2. Select后面查询的字段必须要带上name和age,这样的查询就是覆盖索引查询 3.用关键字Explain,可以看到我们的模糊查询sql是有用上索引的 覆盖索引定义:MySQL执行计划expl

r - 错误 : vector memory exhausted (limit reached?) R 3.5.0 macOS

我一直在处理一些包含基因表达数据的大文件,最近在升级到R3.5.0后,我遇到了将这些数据加载到R中的问题。使用大约8GB内存(我的mac有16GBRAM)后,如果我尝试读取另一个文件,我会收到以下错误:Error:vectormemoryexhausted(limitreached?)我发现之前的帖子(Error:vectormemoryexhausted(limitreached?))建议我尝试将环境变量R_MAX_VSIZE设置为更高的值,因此我尝试了以下操作:Sys.setenv(R_MAX_VSIZE=16e9)但是,我仍然遇到同样的错误。我没有正确设置环境变量吗?有什么我遗漏

r - 错误 : vector memory exhausted (limit reached?) R 3.5.0 macOS

我一直在处理一些包含基因表达数据的大文件,最近在升级到R3.5.0后,我遇到了将这些数据加载到R中的问题。使用大约8GB内存(我的mac有16GBRAM)后,如果我尝试读取另一个文件,我会收到以下错误:Error:vectormemoryexhausted(limitreached?)我发现之前的帖子(Error:vectormemoryexhausted(limitreached?))建议我尝试将环境变量R_MAX_VSIZE设置为更高的值,因此我尝试了以下操作:Sys.setenv(R_MAX_VSIZE=16e9)但是,我仍然遇到同样的错误。我没有正确设置环境变量吗?有什么我遗漏