本教程问题：1.mmGO.rdata文件的制作，是否不需要这一步，更改一下脚本即可实现呢？2.这样的图形美化，目前的图还不是很满意，需要进行美化。这些问题，需要我们大家一起解决，切分享哦！一、前言我们在做组学时，常常遇到多多个处理进行差异分析，获得差异基因或差异代谢物。此后，是对这些差异结果进行GO或KEGG富集分析。这是一个很普遍的结果，但是这样一弄后，我们对多个组合差异基因进行富集分析后，获得多个GO或KEGG富集分析结果，图很多，但是重复的term也是很多，那如何阐述就是个问题，以及很多图列在论文中也不是很美观，只能间部分图放在附件中。那么，我们是不是可以间多个GO或KEGG的term进
往期回顾B站中只有视频课程，代码部分整理在往期推送之中：手把手教你做单细胞测序数据分析（一）——绪论手把手教你做单细胞测序数据分析（二）——各类输入文件读取手把手教你做单细胞测序数据分析（三）——单样本分析手把手教你做单细胞测序数据分析（四）——多样本整合手把手教你做单细胞测序数据分析（五）——细胞类型注释手把手教你做单细胞测序数据分析（六）——组间差异分析及可视化其他单细胞相关技术贴也在这里：细胞的数量由誰决定？答读者问（三）单细胞测序前景答读者问（四）：如何分析细胞亚群答读者问（六）、Seurat中如何让细胞听你指挥单细胞中应该如何做GSVA？如果这期视频看不懂，你可能需要看看这些：上一讲
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前言康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。iTAK是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子(TF)、转录调节因子(TR)和蛋白激酶(PK)，然后将单个TF、TR和PK分类为不同的基因家族的工具。本人能力有限，本文可能存在描述不当与错误的地方，请仔细辨别后使用。鉴定与依据TFs和TRs的识别和分类是基于主要从PlnTFDB(Perez-Rodriguezetal.,2010)和PlantTFDB[(Jinetal.,2014)总结的一致性规则（每个基因家族的必需和禁止的蛋白质结构域），与来自PlantTFcat(Daietal.,2013)和AtTFDB(Yilmazetal
前言康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。iTAK是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子(TF)、转录调节因子(TR)和蛋白激酶(PK)，然后将单个TF、TR和PK分类为不同的基因家族的工具。本人能力有限，本文可能存在描述不当与错误的地方，请仔细辨别后使用。鉴定与依据TFs和TRs的识别和分类是基于主要从PlnTFDB(Perez-Rodriguezetal.,2010)和PlantTFDB[(Jinetal.,2014)总结的一致性规则（每个基因家族的必需和禁止的蛋白质结构域），与来自PlantTFcat(Daietal.,2013)和AtTFDB(Yilmazetal
小编写过有关基因名的坑的推文，总结了有关基因名的十大坑，见：。今天为大家推荐一款很不错的基因名转化在线服务器–GeneToList随着高通量组学技术的日益流行，处理它们所产生的数据集变得越来越困难，因此需要借助于编程语言或者在线服务器，将一个数据库中的基因名转换成另一个数据库中的基因名，例如：biomaRt，MyGene（http://mygene.info）和org.Hs.eg.db；DAVID在线服务器（https://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp），g:Convert（https://biit.cs.ut.ee/gprofiler）以及bioDBnet
小编写过有关基因名的坑的推文，总结了有关基因名的十大坑，见：。今天为大家推荐一款很不错的基因名转化在线服务器–GeneToList随着高通量组学技术的日益流行，处理它们所产生的数据集变得越来越困难，因此需要借助于编程语言或者在线服务器，将一个数据库中的基因名转换成另一个数据库中的基因名，例如：biomaRt，MyGene（http://mygene.info）和org.Hs.eg.db；DAVID在线服务器（https://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp），g:Convert（https://biit.cs.ut.ee/gprofiler）以及bioDBnet
前几天拿到了一个数据，需要做基因注释，是从转录本ID（ENSTxxxxxxxxxx）转为基因ID。数据概况>head(PTC_true_072822$isoform_id,10)[1]"ENST00000167218.9""ENST00000167825.5""ENST00000207636.9""ENST00000210227.4""ENST00000215376.7"[6]"ENST00000215587.11""ENST00000216019.11""ENST00000216658.9""ENST00000221818.5""ENST00000223084.7"1.常用基因ID编号都有哪
前几天拿到了一个数据，需要做基因注释，是从转录本ID（ENSTxxxxxxxxxx）转为基因ID。数据概况>head(PTC_true_072822$isoform_id,10)[1]"ENST00000167218.9""ENST00000167825.5""ENST00000207636.9""ENST00000210227.4""ENST00000215376.7"[6]"ENST00000215587.11""ENST00000216019.11""ENST00000216658.9""ENST00000221818.5""ENST00000223084.7"1.常用基因ID编号都有哪
(全文约1520字)【推荐】用Smudgeplot评估物种倍性后，用组合jellyfish+GenomeScope1.0做二倍体物种的基因组调查，用组合KMC+GenomeScope2.0做多倍体物种的基因组调查。1.k-mer进行基因组调查的软件k-mer进行基因组调查分为k-mer频数统计和基因组特征评估两步。jellyfish可以实现第一步k-mer频数统计。jellyfish的结果sample.histo可以用在GenomeScope上，实现第二步基因组特征评估。2.jellyfish简介jellyfish是CenterforBioinformaticsandComputational
