1.miniconda官网：https://conda.io/miniconda.html；#miniconda下载安装2.anaconda官网：https://anaconda.org/；#Wherepackages,notebooks,projectsandenvironmentsareshared.3.condaactivatebase;#激活base环境；4.condadeactivate;#离开base环境；5..activate;#激活conda环境；6.condaenvlist;#查看conda当前存在哪些环境；7.condalist;#查看conda当前环境安装了哪些软件和包；

目录一.Conda简介二.Conda常用指令1.虚拟环境管理2.模块/包管理一.Conda简介Conda是一个开源的包管理系统和环境管理系统，可在Windows、macOS和Linux上运行。Conda可快速安装、运行和更新包及其依赖项，因此可以轻松地在计算机上创建、保存、加载和切换环境。它本是为Python程序而创造的，因为Python的版本比较多，并且它的库也非常广泛，同时库和库之间存在很多依赖关系，所以在库的安装和版本的管理上很麻烦，因此设计Conda作为一个管理版本和Python环境的工具，但它业可以打包和管理任何语言的软件。conda包含在Anaconda里的，因此安装了Anacon

介绍anaconda相当于linux的一个软件仓库，也相当于一个环境管理器，可以使用conda创建不同环境，安装环境包，而不影响其他环境。下载和安装在官网下载anaconda3的安装脚本：https://www.anaconda.com/products/individual安装也非常简单，直接：bash Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh然后一路yes即可，我没有选择安装VSCode，因为感觉做生信分析没有必要安装conda环境管理condacreate-nR4      # 创建名为R4的新环境conda create -n py2 python=2.7  

Conda是开放源代码的软件包管理系统和环境管理系统。miniconda是Conda的精简版本，我们一般使用miniconda进行生信上游流程软件的安装。相比于其他软件下载方式，其优势在于能简单快捷下载软件及其所需的依赖环境，并且为每个流程创建单独的环境，避免软件之间可能引起的冲突。Conda官网：Conda—Condadocumentationconda.png本例中使用的为windows子系统——Ubuntu，其下载和配置见Windows子系统的体验与配置——Ubuntu-22.04-简书(jianshu.com)1.miniconda3的下载安装切换到安装位置（一般为主目录~），从中科大

文章目录一、为什么要用conda虚拟环境二、pyinstaller用法2.1安装PyInstaller2.2基本用法打包一个Python脚本2.21打包一个Python项目2.22打包选项2.3打包依赖项2.31导出依赖项列表2.32配置依赖项2.4自定义打包选项2.5打包完成后的文件2.6注意事项三、打包示例一、为什么要用conda虚拟环境第一点是，pyinstaller打包需要指定程序中使用的库的路径，新手在这一点上很容易出现问题，导致打包后的exe程序执行的时候显示缺少模块。这个问题可能并不能通过简单地指定路径来解决。第二点就是使用虚拟环境本身的好处了：可以创建多个不同的Python环境

写在前面：在学习自动驾驶领域上的强化学习过程中，我决定使用highwy-env库建设的模拟器来进行环境构建，但是翻阅了众多教程（包含国内国外）之后，发现教程内容过旧，因为随着2023年的到来，highway-env库也进行了更新，前两年的教程无一例外都使用了老旧版本的函数和返回值。highway-env是什么东西？安装方式：（默认最新版）pipinstallhighway-env首先先列出我发现的新库中的改动：以前返回值有四个：        observation,reward,done,info=env.step(action)现在返回值有五个：        observation,re

我在2019年开始使用Pycharm作为python的IDE，最近配置解释器时，法线网上的方法大概过时了，自己尝试了好多次才发现新版本的Pycharm的解释配置方法，故记于此背景描述：我是用conda管理环境的，我已经创建好一个虚拟环境，并安装我所需要的Python包。现在我想在Pycharm项目中配置解释器，使用该虚拟环境我使用的是Pycharm2023.1.4社区版本我之前已经创建了一个Pycharm项目好了下面开始给项目配置解释器：点击左上角File-->点击Setting-->点击PythonInterpreter点击左上角File点击PythonInterpreter点击Addint

conda--help获取命令解释帮助1.管理环境。condainfo-econdainfo--envscondaenvlistconda会显示环境列表@animalia:~$condainfo--envs#condaenvironments:#base*/usr/lib/anaconda3mitosEnv/usr/lib/anaconda3/envs/mitosEnvmitozEnv/usr/lib/anaconda3/envs/mitozEnvmitozEnv1/usr/lib/anaconda3/envs/mitozEnv1@animalia:~$condainfo-e#condaenv

事情源于，我在写脚本的时候，在脚本里面插入了一句condaactivate环境名,然后出现如下的报错提示CommandNotFoundError:Yourshellhasnotbeenproperlyconfiguredtouse'condaactivate'.Toinitializeyourshell,run$condainitCurrentlysupportedshellsare:-bash-fish-tcsh-xonsh-zsh-powershellSee'condainit--help'formoreinformationandoptions.IMPORTANT:Youmayneedt

Verkko是一款能够对HiFi和ONT数据进行混装的工具，是一款可以用于T2T组装的工具。1Verkko安装比较简单，利用conda可直接安装condainstall-cconda-forge-cbioconda-cdefaultsverkko2安装好之后就可以直接运行程序啦！这里我测试了只用HiFi数据进行组装nohupverkko-dverrkko/--hifiHiF_reads.fastq.gz--no-nano--threads80--local-cpus80--local-memory120-d结果输出目录--hifihifireads位置3结果最终会生成下面几个文件组装结果为as